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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002532`

染色体: Chr01 坐标: 43327344-43329010 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002532`
名称	SmilChr01G002532
描述	blue copper protein 1a-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43327344 - 43329010 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026574`
GeneID	`131026574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026574`
原始查询	`LOC131026574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	blue copper protein 1a-like
产物	blue copper protein 1a-like
Arabidopsis	`AT3G17675` (AT3G17675) Cupredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008006] identity=36.9; qcov=0.753; evalue=5.61e-27; confidence=medium
Rice	`Os07g0165900` (OsUCL21) - identity=44.5; qcov=0.79; evalue=2.36e-26; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057812449.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057812449.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057812449.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812449.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43327451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:43327453`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr1:43327453`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr1:43327456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr1:43327558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D4,D5
`Chr1:43328478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:43328541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B51,B64,C22,C3
`Chr1:43328572`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B38,B39
`Chr1:43328572`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr1:43328592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:43328739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,C50,C76,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812449.1

162 aa

162

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 34-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812449.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	34	117	8.6e-23	80.9	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956466.1
AGCAAAATATATAAGCAGTTTTGCAAGATAATAATTAATTAAGTTGAGAAAACATGGCCTCCAAAGCTTTCTTGTTCGCAGTGATCGTGGTTGCGGCAACGGCGGCAGCTCCGGCTTTCGCAGTCGATTACGTCGTTGGAGATGACGACGGTTGGAAATTGAATGTCAATTACACTGCATGGGCTCAAGGGAAAATGTTCTACGTCGGAGACACCATCGCTTTCAAGTATGCGGTGGGAGTGCATAATGTGTACAAAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026574
ATGGCCTCCAAAGCTTTCTTGTTCGCAGTGATCGTGGTTGCGGCAACGGCGGCAGCTCCGGCTTTCGCAGTCGATTACGTCGTTGGAGATGACGACGGTTGGAAATTGAATGTCAATTACACTGCATGGGCTCAAGGGAAAATGTTCTACGTCGGAGACACCATCGCTTTCAAGTATGCGGTGGGAGTGCATAATGTGTACAAAGTGAACGGAAGCGCCTTCCGAGAATGCTGGGTGCCGCCGCCATCAGAGGCCCTAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812449.1
MASKAFLFAVIVVAATAAAPAFAVDYVVGDDDGWKLNVNYTAWAQGKMFYVGDTIAFKYAVGVHNVYKVNGSAFRECWVPPPSEALRTGNDIISLATPGRKWYLCGVGNGTHCESGMKLVITVMSYAPMSAPAPAPAPFPIYGAPTKKPITIWRNWKLKFHF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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