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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000198`

染色体: Chr05 坐标: 1561799-1566059 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000198`
名称	SmilChr05G000198
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1561799 - 1566059 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026588`
GeneID	`131026588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026588`
原始查询	`LOC131026588`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=27.1; qcov=1.03; evalue=7.96e-81; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=25.2; qcov=1.02; evalue=3.58e-69; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057812468.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812468.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812468.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812468.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1562159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,C1,C16,C64,C74
`Chr5:1562272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:1562285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C81
`Chr5:1562317`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B30,B39,B41
`Chr5:1562529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B68
`Chr5:1562533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B31,B55
`Chr5:1563683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:1563823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B3,B30,B34,B38,B39,B41,B54,C24,C55,C56,C75,C83,D1,D9
`Chr5:1563885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:1563904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C16
`Chr5:1563939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B7,C3,C56
`Chr5:1563965`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812468.1

873 aa

436

873

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-92 aa PF00931 NB-ARC 157-319 aa PF23559 WHD_DRP 410-478 aa PF23598 LRR_14 533-833 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812468.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	92	5.5e-14	52.8	Rx N-terminal domain
`XP_057812468.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	157	319	2.8e-41	141.7	NB-ARC domain
`XP_057812468.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	410	478	2.4e-17	63.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057812468.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	533	833	9.2e-13	48.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956485.1
CAATAACCACAGTACCTCTCTCACACACACACTCTCTCCCGAATACTCTCTCTCTCTCTTTAAAAAAAAATTTGAAAAGGTTTATGCCAAATCGAATCAAACCGAACTAAAAATTTACTGTTCGGTTTGAGCAACTGAAACGGTTTGGTTCGGTTTAAAAATTTAGGGGCGGCTTGGGTTCGAATTTTTCCACTACGGTTCGTTTTCAACCCAAATTGCCCGAATGCTCAGCCCCACAATAAGACCATAGTTTGAAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026588
ATGGGGGAGGCTGCAGTGGCATTCTTGCTGGAGCAAGTGAAGGAGGTGGTGATAGGGTACGCCGATCTGATCTTCGGAGCGGAGAATGAGTTGGAGCAGCTGAAGAGCGACCTGGCTTTACTCAAAGGTTTCCTCAAGCAGATGGCGGAGAAGAAGAAGAAGGAAGATCCGTTGAGGATACTGGAGAGGCAGATGAGGGATGCGGTGTACGCGGTCGAGGACACCATAGACAAATGCTTCACCAACGCCATAGCCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812468.1
MGEAAVAFLLEQVKEVVIGYADLIFGAENELEQLKSDLALLKGFLKQMAEKKKKEDPLRILERQMRDAVYAVEDTIDKCFTNAIAKKSFHRSVGLKNVSLAKEVRSIREDKVKPLLDKFATFDFKSAGVQDSLTVSKGDTPIRQNRVVGFDKEEATISGYLKEKTDKLDVISIVGIPGQGKTTLAWKIYQSDEIGYHFPIRIWVNISQVFNSRDVFLEILKRFFPSQDTSSLNFNDLAQTVRACLEKEKFLLVLDDVWSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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