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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000164`

染色体: Chr05 坐标: 1306150-1309232 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000164`
名称	SmilChr05G000164
描述	late blight resistance protein R1-A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1306150 - 1309232 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026597`
GeneID	`131026597`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026597`
原始查询	`LOC131026597`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late blight resistance protein R1-A-like
产物	late blight resistance protein R1-A-like
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=24.3; qcov=1; evalue=1.06e-38; confidence=weak
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=25.3; qcov=0.84; evalue=5.52e-38; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057812488.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057812488.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057812488.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812488.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812488.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1307917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr5:1307937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:1307990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr5:1308011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr5:1308035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B40,C18,C60,C80
`Chr5:1308101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:1308119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C6,D9
`Chr5:1308258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:1308289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:1308296`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A16,A21,A23,A24,A8,B1,B117,B118,B119,B128,B132,B136,B21,B24,B28,B31,B35,B36,B54,B6,B65,B66,B93,C12,C15,C21,C24,C26,C33,C52,C55,C56,C60,C73,C76,C80,C85,C86,D1,D2
`Chr5:1308333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C56,C76
`Chr5:1308338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C52,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812488.1

867 aa

434

867

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 159-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812488.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	326	7e-26	91.5	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956505.1
CCGTTGGGAATGGTCTAAGCTGTAGGCATTGATGGTGGTTTCTTTAATCAATACACATGACTTTGTGGAGAGCCTCAACTACTCATTTTATCAATTGCACCTTCAAAATCCTTATCCTCCCATCGCCTACCGCCGTTGCCAATTTCTTCACCTTCTACCACCACCACCACCACCACCACCACCACAAACTCATATTTCAATCAAGTTATGGCTGCTTATGGTGCAGCGGCTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026597
ATGGCTGCTTATGGTGCAGCGGCTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCTCACTCTCCACAAATCTTGCAACCTGCCTACGACCAGATGTGTCGATTGCAGAAACTTCTGCGATTATTGGACAAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTGCGGATGAACTCATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATATCTTACCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812488.1
MAAYGAAASLKNTIQRILQSSRISLVSHSPQILQPAYDQMCRLQKLLRLLDKTSCSKIRTKVNAADELIKEAVWEFEDLLESHILPQILPQLESERDNLSFFVDLQSLQHRVDCFIEMMEMMEVEYFIEMLNMPEEEGEPISSRIDFGGINSKMVGLSDHIETARDYLLEGNNDNNYSIVGMAGVGKTTLAKHIFEDSSIRSHFELRAWVKVGRKCEFSELLRCILAQVDPHAYLMLAQRDGVDEAELVGILKERLSGKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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