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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000159`

染色体: Chr05 坐标: 1270695-1273908 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000159`
名称	SmilChr05G000159
描述	late blight resistance protein R1-A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1270695 - 1273908 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026602`
GeneID	`131026602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026602`
原始查询	`LOC131026602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late blight resistance protein R1-A-like
产物	late blight resistance protein R1-A-like
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=24.9; qcov=1.02; evalue=6.04e-37; confidence=weak
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=25.3; qcov=0.878; evalue=3.2e-39; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057812494.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057812494.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057812494.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812494.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812494.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1271119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B72,C23,C3
`Chr5:1271120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr5:1271131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B105,B129,B72,C74
`Chr5:1271932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr5:1272114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,D9
`Chr5:1272155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:1272176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr5:1272191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:1272213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,D9
`Chr5:1272242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B26
`Chr5:1272248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C15
`Chr5:1272363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812494.1

860 aa

430

860

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 159-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812494.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	319	4e-29	102.1	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956511.1
ACTCTCCATGAGAGTCACCGTTGGGAATGGTCTAAGCTGTAGGCATTGATGGTGGTTTCTTTAATCAATACACATGACTTTGTGGGGAGCCTCAACTACTCATTTTATCAATTGCACCTTCAAAATCCTTATCCTCCCATCGCCTACCGCCGTTGCCAATTTCTTCACCTTCTACCACCACCACCACCACCACCACCACAAACTCATATTTCAATCAAGTTATGGCTGCTTATGGTGCAGCGGCTTCTCTCAAGAATACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026602
ATGGCTGCTTATGGTGCAGCGGCTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCCTTTCCCACTCTCCACAAATCTTACAGCCTGTCTACGACGAGATGGATGAGTTGCAGAAATTTCTGCTAGGATTGGATTACACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTGTGGATGAACGAATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATGTCTTACCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812494.1
MAAYGAAASLKNTIQRILQSSRISLLSHSPQILQPVYDEMDELQKFLLGLDYTSCSKIRTKVNAVDERIKEAVWEFEDLLESHVLPQILQQLESERHNLSFFVDLQSLQHSVDCFVEMVKMMEFEYFIEMLNMPEEEGEPISARIDFGGINSKMVGLSDEFEKARDYLLEGNNENNYSIVGMAGVGKTTLARHIFEDSSIRSHFELRAWVKVGRKCEFNELLRCILAQVVAQKDDDDEAELVGILKERLSGKNCLIVLDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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