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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000125`

染色体: Chr05 坐标: 1005997-1011007 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000125`
名称	SmilChr05G000125
描述	protein STICHEL-like 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1005997 - 1011007 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026609`
GeneID	`131026609`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026609`
原始查询	`LOC131026609`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein STICHEL-like 2
产物	protein STICHEL-like 2
Arabidopsis	`AT4G24790` (AT4G24790) AAA-type ATPase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828581] identity=47; qcov=0.691; evalue=1.32e-139; confidence=high
Rice	`Os08g0120200` - identity=40.3; qcov=0.856; evalue=1.44e-120; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003689 (DNA clamp loader activity); GO:0003887 (DNA-directed DNA polymerase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005663 (DNA replication factor C complex); GO:0006261 (DNA-templated DNA replication); GO:0006281 (DNA repair); GO:0009360 (DNA polymerase III complex)
KEGG	-
Pfam	PF13177 (DNA_pol3_delta2); PF22608 (DNAX_ATPase_lid); PF23007 (DnaA_N-like_STI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026609

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812504.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812504.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812504.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812504.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1006204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr5:1006385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B16
`Chr5:1006390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B33,B66,B97
`Chr5:1006982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B50
`Chr5:1006983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B48,B62,B8,B81
`Chr5:1007000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:1007125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B34,C38,C39,D11
`Chr5:1007126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B122,B131,C2
`Chr5:1007155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B131,C2,D10
`Chr5:1007225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B34,C38,C39,D11
`Chr5:1007299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:1007315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B28,B5,B62,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812504.1

797 aa

398

797

DNA_pol3_delta2

DNAX_ATPase_lid

DnaA_N-like_STI

PF13177 DNA_pol3_delta2 201-355 aa PF22608 DNAX_ATPase_lid 361-401 aa PF23007 DnaA_N-like_STI 574-654 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812504.1`	Pfam	`PF13177`	DNA_pol3_delta2	Domain	201	355	4.4e-23	82.7	DNA polymerase III, delta subunit
`XP_057812504.1`	Pfam	`PF22608`	DNAX_ATPase_lid	Domain	361	401	7.3e-09	36.0	DNA polymerase III clamp loader subunit, ATPase lid domain
`XP_057812504.1`	Pfam	`PF23007`	DnaA_N-like_STI	Domain	574	654	8.6e-26	90.6	STICHEL, DnaA_N-like alpha-beta domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956521.1
CAAAAATCTGCTGAGAAAACAACACCACAACAGGACCAGTGTAAATAAAAATATACGTTGTCAGAATTCCACCTCTCCCCATTTTTCTGAAACTAAAGCCTTTCACTTTATATATCAGCTAGAGTAAAATAATCAAGAATTTTACCACCGTATTTATTGTGATGTCACGCACATCGCCCTCTCCCATTTATTGCGTTTGCTGCTTTTTACCGCTCCGCCACCTCCAAGAACATGACTTGACGCTGCTTTGGGCGGCTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026609
ATGGATGGGCGGCGGCATTCCGTTGATCTTCCGATTTCAAGAACGTTGTTTGCGCTGAGGCGAGTGAGGTCCCTCCGCGATCCATCCACCACTACCTCGATGAGCAGATTGTCTGCGTTGGTCGACACTCTGAGCTGGGAGACGAGGTTGAGCAATGCAGCTGTATTAGGATTCGAGAATGGCTTGGATGATGGCAACGTTTCCGGCTTGAGAAGCTCGAGTTTGAGAGATTGTGACTTGGAAGATGTGTTGCAGTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812504.1
MDGRRHSVDLPISRTLFALRRVRSLRDPSTTTSMSRLSALVDTLSWETRLSNAAVLGFENGLDDGNVSGLRSSSLRDCDLEDVLQLQSESLRSSCARPRRRLRHVDKACRGKSKCGSSRNRKHRVRGGDVLSSASDASMEGLSGGGRDRDRDRAVRPLLLSTEEEGTGCQQNGVGIEPCLETPRSLCQKFMPRSFQELVGQNVVVRSLVSAVSSERIASLYLFHGPRGTGKTSSARVFAAALNCLSPEVEKPCGSCRGCA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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