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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000131`

染色体: Chr05 坐标: 1067139-1070320 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000131`
名称	SmilChr05G000131
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1067139 - 1070320 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026628`
GeneID	`131026628`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026628`
原始查询	`LOC131026628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance RPP13-like protein 2
产物	putative disease resistance RPP13-like protein 2
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=35; qcov=0.468; evalue=1.51e-21; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=32.6; qcov=0.488; evalue=1.93e-25; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026628

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057812527.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812527.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812527.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812527.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812527.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1067225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C31
`Chr5:1067250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C72,D2
`Chr5:1067251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C72,D2
`Chr5:1067256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C34
`Chr5:1067263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C77
`Chr5:1067282`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A14,A2,B114,B137,B25,B37,B56,B57,B61,B71,C16,C3,C37,C56,C78
`Chr5:1067284`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A11,A21,A9,B100,B103,B105,B109,B113,B129,B136,B17,B22,B23,B26,B28,B33,B41,B42,B44,B55,B60,B68,B77,B91,B94,C12,C13,C15,C18,C2,C31,C47,C51,C66,C69,D2
`Chr5:1067384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:1067410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C10
`Chr5:1067469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr5:1067537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr5:1067584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B128,B80,C52,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812527.1

477 aa

238

477

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 246-398 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812527.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	246	398	1.6e-24	87.1	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956544.1
CTCTCACTTTAACAATTCCACCGCCGCTTCAGACCTTCTACCACAAACTCATATTTCAATCAAGTTATGGCGGCTTATGGTGCGGCGACTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCTTCTCGCATTTCTCTCGTTTCTCACTCTCCACAAATCGTATTCTCAGCTCATGGTGCAGCGACTTTTCTCAAGAATGCGATGTTTTTTTGCATTTTGCTCGCTTCCCCCTCTCCACAAATCGTATTCTCAGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026628
ATGGCGGCTTATGGTGCGGCGACTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCTTCTCGCATTTCTCTCGTTTCTCACTCTCCACAAATCGTATTCTCAGCTCATGGTGCAGCGACTTTTCTCAAGAATGCGATGTTTTTTTGCATTTTGCTCGCTTCCCCCTCTCCACAAATCGTATTCTCAGATGATTTGGGTGTGGCGGCTTATGGTGCAGCGACTTCTCTCAAGAATACGATTCACCGTATTCTACAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812527.1
MAAYGAATSLKNTIQRILQSSRISLVSHSPQIVFSAHGAATFLKNAMFFCILLASPSPQIVFSDDLGVAAYGAATSLKNTIHRILQSFRISLFSHSPQILQPAYDQMDRLQKVLLKLDETSCSKIRTRVNAADEGIKEAVWEFEDLLESHVLHQILPQLESRSDGERDNSSFSVDLQSLQHHVDCFVEKMKMMEEEYTNEMENMAEEEGEPISSRIDFGGINSKMVGLSHEFQRARDYLLQENNDYSLIGMAGVGKTTLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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