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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000005`

染色体: Chr01 坐标: 145226-147216 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000005`
名称	SmilChr01G000005
描述	polygalacturonase At1g48100-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	145226 - 147216 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016588`
GeneID	`131016588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016588`
原始查询	`SmilChr01G000005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase At1g48100-like
产物	polygalacturonase At1g48100-like
Arabidopsis	`AT1G02460` (AT1G02460) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839443] identity=68.5; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0296200` (OsPGL13) - identity=58.9; qcov=0.897; evalue=3.65e-174; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057801282.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057801282.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801282.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801282.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801282.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:145775`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B100,B19
`Chr1:145775`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B100,B19
`Chr1:146234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:146461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:146860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:146942`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	B100,B102,B108,B126,B127,B22,B53,B7,B99,C16,C2,C41,C59,C72,D11,D9
`Chr1:146967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801282.1

452 aa

226

452

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 92-405 aa

XP_057801290.1

437 aa

218

437

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 92-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801282.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	92	405	1.2e-86	291.5	Glycosyl hydrolases family 28
`XP_057801290.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	92	390	2e-86	290.7	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945299.1
CTCACAAATATTATATATAGATGGAAACTGGTTTTGCATGTCATTCACAAACAGATTGAAGGCAATTAAGTTGATGTTAGTGGTGAGTTCGGTTGCTCATACTTTAGAAAAAGCTTCTTACAACTTTCTTAACCTAAACCTAGTTTGTCACTCTCACACTCGTGTCTTTTCATTCATCTGTCACCATCCCTCCTTTAATTTGTCAAAAAGATGGTGGCGTTTCGCCCTTCCCTTTTGGTATTTTATTTCATCAGTTGCAT...

XM_057945307.1
GGTTTTGCATGTCATTCACAAACAGATTGAAGGCAATTAAGTTGATGTTAGTGGTGAGTTCGGTTGCTCATACTTTAGAAAAAGCTTCTTACAACTTTCTTAACCTAAACCTAGTTTGTCACTCTCACACTCGTGTCTTTTCATTCATCTGTCACCATCCCTCCTTTAATTTGTCAAAAAGATGGTGGCGTTTCGCCCTTCCCTTTTGGTATTTTATTTCATCAGTTGCATCGGAGTTATGAATGCTAGATCTCACCACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016588
ATGGTGGCGTTTCGCCCTTCCCTTTTGGTATTTTATTTCATCAGTTGCATCGGAGTTATGAATGCTAGATCTCACCACCACCATAAGAGGCATATGCATAGGCATTCCCACCAAATTTCCATTCCTCCAGCGGCGGCGCCGCCCTCCTCAGACGAGAACAACAGCGGAGTGTACGACGTTAGAATGTTTGGCGGCGTTGGCGATGGCGTGACAGATGATACCGAAGCATTCAAAGCTGCATGGGAAAATGCATGCCAAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801282.1
MVAFRPSLLVFYFISCIGVMNARSHHHHKRHMHRHSHQISIPPAAAPPSSDENNSGVYDVRMFGGVGDGVTDDTEAFKAAWENACQTESGVLLVPNGYTFMIQSTIFSGPCENGLVFQVEGTITPPDGPEWWPKNYSRRQWLVFYRINEISLRGGGLIDGRGHPWWNLPCKPHKVANGSIVREPCDSPIAIRFFMSNNVRVEGIKMKDSPQFHFRFDSCQNVHIESIYISAPPLSPNTDGIHIENTNNVEIYNSVISNGD...

XP_057801290.1
MVAFRPSLLVFYFISCIGVMNARSHHHHKRHMHRHSHQISIPPAAAPPSSDENNSGVYDVRMFGGVGDGVTDDTEAFKAAWENACQTESGVLLVPNGYTFMIQSTIFSGPCENGLVFQVEGTITPPDGPEWWPKNYSRRQWLVFYRINEISLRGGGLIDGRGHPWWNLPCKPHKAIRFFMSNNVRVEGIKMKDSPQFHFRFDSCQNVHIESIYISAPPLSPNTDGIHIENTNNVEIYNSVISNGDDCVSIGSGCYDVDIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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