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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000017`

染色体: Chr01 坐标: 367638-370713 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000017`
名称	SmilChr01G000017
描述	uncharacterized SmilChr01G000017
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	367638 - 370713 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007172`
GeneID	`131007172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007172`
原始查询	`SmilChr01G000017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717365]; symbol=AT1G55865; hit=AT1G55865; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717365]; symbol=AT1G55865; hit=AT1G55865; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G55865` (AT1G55865) ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717365] identity=43; qcov=0.249; evalue=6.78e-16; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790323.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057790323.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057790323.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790323.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790323.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:368179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr1:369059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B47,B9,B95
`Chr1:369065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B47,B9,B95
`Chr1:369216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B32,B36
`Chr1:369316`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A14,B118,B123,B136,B25,B32,B36,B78,C10,C16,C25,C26,C33,C35,C46,C51,C54,C80,C82,D2,D9
`Chr1:369366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B9,B95
`Chr1:369435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:369443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B6,C67
`Chr1:369589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B75,C55
`Chr1:369765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B47,B9,B95
`Chr1:369881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B40,B71,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934340.1
ATTCAGCTTCCATTGGAATGGCTTGAAGCAAGAAATTATAATCAATTTTATCTTAGAAAAGTGTTTGGAGAGAGAGATTGCACACCTCCTCTACCTCCAGTACTTGAAGTTTGTGACACAATAACTCAAGGAGAAAGAAAGCGGCAACAACATCATTCTTGAACAGCAAGCCTAGGAAATGGAATGAGCGGTTTGAATTCTAGTGATCGAAGTTGTCTCTGAAAGTCCTCCGCTTGTTATGCTTCACCTGCACTCACAAT...

XM_057934341.1
AAAAATAAACCATAAAACGTGTTGCCTTATTATTCTATTTCCAAAACCCAAAAGGCAATAGAAAGAAAGAAAGCAAAAAATCGTTTCTTTGCCGTAAAACCTTGGAGAATCAATGGGTGTTCCGACAGCAGTGTTTACTGAGACAAACCTGGGAACCTACCTCGCCGTTCCGGCCTCTCCGGACATCACGGCCGACGACTTCAAGAGGGAGGTGGAAATGGCACATCTCAATTGTTTCCCCGAATTCGGAACTATAAGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007172
ATGGGTGTTCCGACAGCAGTGTTTACTGAGACAAACCTGGGAACCTACCTCGCCGTTCCGGCCTCTCCGGACATCACGGCCGACGACTTCAAGAGGGAGGTGGAAATGGCACATCTCAATTGTTTCCCCGAATTCGGAACTATAAGGGTCAAAGCAGTGATGGTGACGCAAAAATTACAACGTTATCACTTATCGGGGTCTTTGCCTCTCAAGTTTGCCTTTCTGGGTTCAAATGTTAATTGGTTTCTTCAAGCACACGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790323.1
MGVPTAVFTETNLGTYLAVPASPDITADDFKREVEMAHLNCFPEFGTIRVKAVMVTQKLQRYHLSGSLPLKFAFLGSNVNWFLQAHVILSNVPTRVESRRHNGAEVCNLNSAANVITDSVEVAGASYEKRTKCKRKIKVGGFLKISTALCFRRKWKRKNVKKKPETRHPIRGRMQHCLVEKEMLCEFATGAEMNLSKKSDSNVIGEATSETISVSGIINKYFSDYDEVASNPESLFTTARYRCRKQRTGCEYWSGVVKSH...

XP_057790324.1
MGVPTAVFTETNLGTYLAVPASPDITADDFKREVEMAHLNCFPEFGTIRVKAVMVTQKLQRYHLSGSLPLKFAFLGSNVNWFLQAHVILSNVPTRVESRRHNGAEVCNLNSAANVITDSVEVAGASYEKRTKCKRKIKVGGFLKISTALCFRRKWKRKNVKKKPETRHPIRGRMQHCLVEKEMLCEFATGAEMNLSKKSDSNVIGEATSETISVSGIINKYFSDYDEVASNPESLFTTARYRCRKQRTGCEYWSGVVKSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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