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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000018`

染色体: Chr01 坐标: 371113-373408 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000018`
名称	SmilChr01G000018
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	371113 - 373408 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007168`
GeneID	`131007168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007168`
原始查询	`SmilChr01G000018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
产物	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
Arabidopsis	`AT1G56670` (AT1G56670) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842122] identity=54.2; qcov=1; evalue=2.71e-139; confidence=high
Rice	`Os01g0329900` (OsGELP14) - identity=50.8; qcov=0.982; evalue=3.55e-122; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057790317.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057790317.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790317.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790317.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790317.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:371617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B35,B83,C35,D6
`Chr1:371718`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A19,A23,B1,B10,B104,B124,B139,B140,B24,B35,B38,B39,B5,B53,B55,B68,B83,B93,C2,C35,C5,C74,C8,C85,D1,D10,D6
`Chr1:371762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:371779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:371932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:372681`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C71
`Chr1:372681`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C71
`Chr1:372684`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C71
`Chr1:372684`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C71
`Chr1:372704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C48
`Chr1:372779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B48,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790317.1

362 aa

181

362

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 34-344 aa

XP_057790318.1

341 aa

170

341

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 13-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790317.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	34	344	7.2e-45	154.4	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase
`XP_057790318.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	13	323	5.8e-45	154.7	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934335.1
TTTGGATGCAATTCATTTTTATGATAAGATGATGCATCATATGTGTTCCATATATGCCACCACTGCATTTATAGTGGAGAGCCAAATAAGTGTTCAATGCATTAATCACACAGCCTCAGTCGAATTAGTGCTTTATCTAGAATAAATCAATACTAGTTAGTCAATAATGTGAAAACACAAAGGAAATAGTCGTCTTTTTTTTAAGAAAATGAAAGAGTTTTGACTTGCTAGATTCTTCATTTAGGCCTATCTACATCCAC...

XM_057934334.1
TTTAACAAGATATATTCTGGTCTCTATATATATTAAGGTGCCAGTTTTTCATTTGTGAGAGTGGTAGTAAATTAAAGATGTGTTGTTATTACAAAAAAGGGTTTGTCTTAGCTTGTGTGACGTTTTCAATGCTCATGTTTGATGCTGCTTCACAGTGCAGCAGGAAAGCAGTGATGTTCAACTTCGGCGATTCAAATTCAGACACCGGCGGCCTTGCTGCTGCGATGGGCTACGAGTTCGGATATCCGGACGGCCGCGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007168
ATGACAAGCATTTTGTGCAGCAGGAAAGCAGTGATGTTCAACTTCGGCGATTCAAATTCAGACACCGGCGGCCTTGCTGCTGCGATGGGCTACGAGTTCGGATATCCGGACGGCCGCGCCTTCTTCCATCGCCCCACAGGTCGACTATGTGATGGTCGCCTTATCATCGATTTCCTGTGCGAAAATGTGAAGTCAAATTACTTGAGTCCTTATCTGGAATCAGTGGAGCCAGATTTCTCAAATGGAGCCAACTTCGCCAT...

LOC131007168
ATGTGTTGTTATTACAAAAAAGGGTTTGTCTTAGCTTGTGTGACGTTTTCAATGCTCATGTTTGATGCTGCTTCACAGTGCAGCAGGAAAGCAGTGATGTTCAACTTCGGCGATTCAAATTCAGACACCGGCGGCCTTGCTGCTGCGATGGGCTACGAGTTCGGATATCCGGACGGCCGCGCCTTCTTCCATCGCCCCACAGGTCGACTATGTGATGGTCGCCTTATCATCGATTTCCTGTGCGAAAATGTGAAGTCAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790317.1
MCCYYKKGFVLACVTFSMLMFDAASQCSRKAVMFNFGDSNSDTGGLAAAMGYEFGYPDGRAFFHRPTGRLCDGRLIIDFLCENVKSNYLSPYLESVEPDFSNGANFAIAGSATLPRYVAFSLSVQILEFRRFRNHSLQLQSKGHVVGEDDFKNGLYMIDIGQNDLTAAFNNVPYDQILQKIPSFISEIKDAMWSIYLTGGKKLWVHNTGPLGCLPEKLGTLKPTASQVDEHGCVASMNQAAQVFNSQLRDLCQQLRGQMK...

XP_057790318.1
MTSILCSRKAVMFNFGDSNSDTGGLAAAMGYEFGYPDGRAFFHRPTGRLCDGRLIIDFLCENVKSNYLSPYLESVEPDFSNGANFAIAGSATLPRYVAFSLSVQILEFRRFRNHSLQLQSKGHVVGEDDFKNGLYMIDIGQNDLTAAFNNVPYDQILQKIPSFISEIKDAMWSIYLTGGKKLWVHNTGPLGCLPEKLGTLKPTASQVDEHGCVASMNQAAQVFNSQLRDLCQQLRGQMKDSTIVYVDVYSIKYSLIANSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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