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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000043`

染色体: Chr01 坐标: 707774-710491 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000043`
名称	SmilChr01G000043
描述	pectinesterase 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	707774 - 710491 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007170`
GeneID	`131007170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007170`
原始查询	`SmilChr01G000043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase 4-like
产物	pectinesterase 4-like
Arabidopsis	`AT2G47030` (VGDH1) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819317] identity=49; qcov=0.927; evalue=1.51e-100; confidence=high
Rice	`Os04g0458900` (OsPME14) - identity=49.3; qcov=0.921; evalue=3.85e-97; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790320.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057790320.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057790320.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790320.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790320.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790320.1

328 aa

164

328

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 25-311 aa

XP_057790321.1

328 aa

164

328

Pectinesterase

PF01095 Pectinesterase 25-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790320.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	25	311	3.9e-104	348.3	Pectinesterase
`XP_057790321.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	25	311	3.9e-104	348.3	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934338.1
AATCCCATTCTAATTTCTCAACATTTCTGTCTCGATCCTCTGTGAAAATCCAATCATCTCTCAATCACAATTATTCGAATTACTACTATCATATTTCGATCCTCTTCGATTTCTAATATTTTTTCGATTGATTTGCTTAATTCAAAATTTCCTATGGATCGATCTTAATTTGATATTTTTCTGCATCAGTTTTTCAATTCTACGATTGAACAATTGATTGCATATTTGAATGTTCTATATGAAGATGAGAATAGATCTGT...

XM_057934337.1
GATCCTCTGTGAAAATCCAATCATCTCTCAATCACAATTATTCGAATTACTACTATCATATTTCGATCCTCTTCGATTTCTAATATTTTTTCGATTGATTTGCTTAATTCAAAATTTCCTATGGATCGATCTTAATTTGATATTTTTCTGCATCAGTTTTTCAATTCTACGATTGAACAATTGATTGCATATTTGAATGTTCTATATGAAGATGAGAATAGATCTGTTTATGCAATTAATCTGAGTCAAGGAAGAGTATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007170
ATGTTGTTAATAAAGATTTGTTATTGTGCAAAGCTGAATATATATATTGATAAATTGAGGTATTTCTTACAAAATTTCAAGACCATCAGCGAAGCTCTCAATGCTTACCCGCCCAAATTCAAGGGCAGATTCGTCATCCACGTCAAGGCCGGCGTCTACAACGAGCAGGTCATCGTGGACAAGAAGAAGCCTAATGTCTTCATCTACGGAGACGGCATTGCCAAGACCATTGTGACGGGCAGCAAGAACTACGGCATTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790320.1
MLLIKICYCAKLNIYIDKLRYFLQNFKTISEALNAYPPKFKGRFVIHVKAGVYNEQVIVDKKKPNVFIYGDGIAKTIVTGSKNYGIMNIGTMHTATFANEASGFIARGMSFRNEAGPQGHQAVAFRSQGDKTALFDCSFEGSQDTLYYQNLKQFYRNCRIYGTVDFIFGKGDCVIQDSQIIVRKPLPNQFNTVTADGREIKRGSNGLVLHHCSIVPDDYLWPVRFQIPTFLGRPWKPEALTVVMQSTLGDFIRPEGWKIW...

XP_057790321.1
MLLIKICYCAKLNIYIDKLRYFLQNFKTISEALNAYPPKFKGRFVIHVKAGVYNEQVIVDKKKPNVFIYGDGIAKTIVTGSKNYGIMNIGTMHTATFANEASGFIARGMSFRNEAGPQGHQAVAFRSQGDKTALFDCSFEGSQDTLYYQNLKQFYRNCRIYGTVDFIFGKGDCVIQDSQIIVRKPLPNQFNTVTADGREIKRGSNGLVLHHCSIVPDDYLWPVRFQIPTFLGRPWKPEALTVVMQSTLGDFIRPEGWKIW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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