当前解析结果
SmilChr01G000072| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000072 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000072 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 1235882 - 1236703 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006457 |
|---|---|
| GeneID | 131006457 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006457 |
| 原始查询 | SmilChr01G000072 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | ATMG00310- identity=41.4; qcov=0.513; evalue=1.58e-34; confidence=medium |
| Rice | Os06g0484800- identity=31.8; qcov=0.945; evalue=3.63e-36; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006457 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057789599.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057789599.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057789599.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789599.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789599.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:1235888 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,C29,D6 |
Chr1:1236015 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B138 |
Chr1:1236015 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B138 |
Chr1:1236016 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B40,C29,D6 |
Chr1:1236147 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C64 |
Chr1:1236181 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B40,C29,D6 |
Chr1:1236196 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:1236203 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B134 |
Chr1:1236203 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr1:1236222 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B104,B2,C2,C8 |
Chr1:1236222 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B2,C2,C8 |
Chr1:1236271 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B22,C26,C65,C76,D1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。