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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000073`

染色体: Chr01 坐标: 1269387-1271849 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000073`
名称	SmilChr01G000073
描述	uncharacterized SmilChr01G000073
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1269387 - 1271849 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006458`
GeneID	`131006458`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006458`
原始查询	`SmilChr01G000073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.7; qcov=0.089; evalue=1.7e-06; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=29.8; qcov=0.121; evalue=5.06e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006458

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789600.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789600.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789600.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057789600.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057789600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1269391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B119,C31,C58
`Chr1:1269393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D7
`Chr1:1269400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B77,C46
`Chr1:1269410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B14,C1,C45,D9
`Chr1:1269438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A16,B104,B12,B6,C68
`Chr1:1269438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B104,B12,B6,C68
`Chr1:1269474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:1269536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B80,C14,C48,C81,D8
`Chr1:1269786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A1,B100,B108,B119,B137,B138,B14,B37,B42,B48,C39,C45,C82,C87
`Chr1:1269802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B14,C39,C45
`Chr1:1269824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C49
`Chr1:1269836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B63,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933617.1
ATGGCAGAAAATCCGGAAGGACAGAATGACAACAACAACAACAAGACCCTTCGAGACATGATGTTTCCAAGCAACCTGAATCTCAGGCCGTCAGCCATAGTACTACCGGAGATCACTGGAAATTGGGAGCTGAAGCATACTCTTATCCAGATTTTGCCCAAGTACAGAGCGAGGGAGTGGTTGTATGATTTGCCAGAAGGAAGCATTCGGACCTGGCAGGAGTTACAGAGCAAGTTTTTGGAAAGATACTTCCCTGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006458
ATGGCAGAAAATCCGGAAGGACAGAATGACAACAACAACAACAAGACCCTTCGAGACATGATGTTTCCAAGCAACCTGAATCTCAGGCCGTCAGCCATAGTACTACCGGAGATCACTGGAAATTGGGAGCTGAAGCATACTCTTATCCAGATTTTGCCCAAGTACAGAGCGAGGGAGTGGTTGTATGATTTGCCAGAAGGAAGCATTCGGACCTGGCAGGAGTTACAGAGCAAGTTTTTGGAAAGATACTTCCCTGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789600.1
MAENPEGQNDNNNNKTLRDMMFPSNLNLRPSAIVLPEITGNWELKHTLIQILPKYRAREWLYDLPEGSIRTWQELQSKFLERYFPAARIQNLRTRISNIKMGTGEILYEYWGRFKQMLAKCPQHQIPDHDLIRYFVGGLRRQDRQWLHAACGGSILNKSAAEAFKLIADMADESRDEEGTIVRTTPVPNPSAQDDKLDKLCNMFEKFMTNQGTPNQGIPNIRKPVKACQLCMANSHATDECPQLFEDEELNAIGQQPGGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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