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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000076`

染色体: Chr01 坐标: 1330362-1331297 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000076`
名称	SmilChr01G000076
描述	uncharacterized SmilChr01G000076
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1330362 - 1331297 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006462`
GeneID	`131006462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006462`
原始查询	`SmilChr01G000076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789602.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057789602.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789602.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789602.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1330377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C27,C41
`Chr1:1330442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,C2,C27,C41,C8
`Chr1:1330443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C27,C41
`Chr1:1330456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B40,C29,D6
`Chr1:1330468`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B50
`Chr1:1330468`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B50
`Chr1:1330473`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B50
`Chr1:1330473`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B50
`Chr1:1330478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:1330553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C14
`Chr1:1330617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A11,A5,B108,B11,B132,B136,B49,B54,B62,B76,B84,B99,C1,C2,C25,C27,C40,C41,C43,C47,C5,C75,C8
`Chr1:1330629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A11,A5,B108,B132,B136,B49,B54,B62,B76,B84,B99,C1,C25,C40,C43,C47,C5,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789602.1

265 aa

132

265

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 4-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789602.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	4	69	1.8e-10	41.7	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933619.1
ATGTTGGATTACACTGGAAAAGAGGATCATGAAGCCCACATGGCCCGATTCGAAAGTCTTATGACACTACACCAGTACAACGAGGGTATTCGCTGCAGACTTTTCTCAACAACCCTGTCAGGACTGGCGCAAAAATGGTTTTACAAATTGGACCCAGGGTCCATCCATAACTTCAACGAGCTTTATGATGTGTTCATGCATCAATTCTCCAGTTCCAATAGAGCAGAGAAAACAACCATGTCTTTAATGGACATACAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006462
ATGTTGGATTACACTGGAAAAGAGGATCATGAAGCCCACATGGCCCGATTCGAAAGTCTTATGACACTACACCAGTACAACGAGGGTATTCGCTGCAGACTTTTCTCAACAACCCTGTCAGGACTGGCGCAAAAATGGTTTTACAAATTGGACCCAGGGTCCATCCATAACTTCAACGAGCTTTATGATGTGTTCATGCATCAATTCTCCAGTTCCAATAGAGCAGAGAAAACAACCATGTCTTTAATGGACATACAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789602.1
MLDYTGKEDHEAHMARFESLMTLHQYNEGIRCRLFSTTLSGLAQKWFYKLDPGSIHNFNELYDVFMHQFSSSNRAEKTTMSLMDIQQEPQETLSEYAARFNMAALELEESKAAGKADAERNMAKKTGKMEERNENRYPDKPCVRAPPPRGPTMYNINTKQEHLPKAGERKTEDVEHRPLIRGRTKDSEEDVNHRSLGFTMYTPLNQSQEDIFHTIKNYRWFYPPRFYNEGPSQLGPNSLLCEFHSQLGHTTEGCSHLKNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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