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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000095`

染色体: Chr01 坐标: 1694350-1696209 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000095`
名称	SmilChr01G000095
描述	uncharacterized SmilChr01G000095
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1694350 - 1696209 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007150`
GeneID	`131007150`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007150`
原始查询	`SmilChr01G000095`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237]; symbol=AT4G21520; hit=AT4G21520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237]; symbol=AT4G21520; hit=AT4G21520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G21520` (AT4G21520) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237] identity=80.1; qcov=0.664; evalue=1.66e-98; confidence=high
Rice	`Os03g0738000` (OsWD40-88) - identity=78.9; qcov=0.664; evalue=2.9e-91; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007150

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790293.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790293.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790293.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790293.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790293.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1694351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:1694367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A19,B127,B23,B58
`Chr1:1694390`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A1,A20,A3,B119,B45,B54,B72,B82,C11,C78
`Chr1:1694628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:1694636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:1694805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C68,D10
`Chr1:1694940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:1695244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74
`Chr1:1695266`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr1:1695266`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr1:1695363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:1695373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C41,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790293.1

250 aa

125

250

WD40

PF00400 WD40 70-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790293.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	70	108	3.1e-13	50.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934310.1
GGGTATTTTTTCTACAGAGTATCTTGTGATTAAGTAGATTATCATGTAGATTTATTGACGCGTGCTTGATAATTTCTGATCATGATATTTGCTGGATACAATAAAGCTATCAGAATTTTTGAGGTTCATCGCCCAGGGAGAGATTTTGAACAACACTCGACTGTTTTAGGAAACAAAGAAGGCCAATCAGGTATTATATCTTCTATTGCTTTTTCCCCCACTTCTTCTGGTATGCTGGCTGTGGGCTCCTACAACCAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007150
ATGATATTTGCTGGATACAATAAAGCTATCAGAATTTTTGAGGTTCATCGCCCAGGGAGAGATTTTGAACAACACTCGACTGTTTTAGGAAACAAAGAAGGCCAATCAGGTATTATATCTTCTATTGCTTTTTCCCCCACTTCTTCTGGTATGCTGGCTGTGGGCTCCTACAACCAGACTACTGCTATATACAGAGAAGACAATATGGAACTGCTGTATGTGTTGCATGGCCAAGAAGGTGGGGTTACACAAGTTCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790293.1
MIFAGYNKAIRIFEVHRPGRDFEQHSTVLGNKEGQSGIISSIAFSPTSSGMLAVGSYNQTTAIYREDNMELLYVLHGQEGGVTQVQFSKDGNYLYSGGRKDPYILCWDIRKTVDIVYKLYRSSESTNQRIQFAIEPLGRYLGTGGQDGLVHIYDLQTGEWVSSFQAALGSLILLFIPVCLIRKIIFLRFLVGEGAHMWVKSKGIATDGTIEDADEWLVNFERAQAEIAKIRELDDDEDENTDTSAENFGD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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