当前解析结果
SmilChr01G000135| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000135 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000135 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000135 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 2285651 - 2289043 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007259 |
|---|---|
| GeneID | 131007259 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007259 |
| 原始查询 | SmilChr01G000135 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os07g0658100; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os07g0658100; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G47115 (AT2G47115)protein rolling protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819324] identity=48.5; qcov=0.881; evalue=7.58e-75; confidence=high |
| Rice | Os07g0658100- identity=47.4; qcov=1.1; evalue=1.38e-86; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007259 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057790396.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057790396.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790396.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790396.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790396.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:2285950 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C56 |
Chr1:2287285 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr1:2287336 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,C2 |
Chr1:2287805 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。