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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000160`

染色体: Chr01 坐标: 2693414-2698173 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000160`
名称	SmilChr01G000160
描述	uncharacterized SmilChr01G000160
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2693414 - 2698173 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007276`
GeneID	`131007276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007276`
原始查询	`SmilChr01G000160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825397]; symbol=AT3G62240; hit=AT3G62240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825397]; symbol=AT3G62240; hit=AT3G62240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G62240` (AT3G62240) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825397] identity=51.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0279400` (OsRFP) - identity=48.1; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0043022 (ribosome binding); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity); GO:0072344 (rescue of stalled cytosolic ribosome)
KEGG	-
Pfam	PF23202 (PAH_ZNF598); PF23230 (zf-C2H2_13); PF25447 (RING_ZNF598)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057790406.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790406.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790406.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057790406.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057790406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2693821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:2693898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B21,B91,C57,D1
`Chr1:2694110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:2695869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:2695871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:2696323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B65,B75
`Chr1:2696360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B41,C76
`Chr1:2696424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B76
`Chr1:2696431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:2696675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:2696817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B33,B98,C14
`Chr1:2696960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790406.1

846 aa

423

846

RING_ZNF598

zf-C2H2_13

PAH_ZNF598

PF25447 RING_ZNF598 2-61 aa PF23230 zf-C2H2_13 218-274 aa PF23202 PAH_ZNF598 593-667 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790406.1`	Pfam	`PF25447`	RING_ZNF598	Domain	2	61	1.2e-08	35.8	ZNF598 RING finger domain
`XP_057790406.1`	Pfam	`PF23230`	zf-C2H2_13	Domain	218	274	6.4e-15	55.8	C2H2-type zinc finger
`XP_057790406.1`	Pfam	`PF23202`	PAH_ZNF598	Repeat	593	667	1.1e-21	77.6	ZNF598 PAH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934423.1
GGAATTTTGTTTTTATTATTGTTCGTAAAGTCATTCATACACTATCCGATACTCCCTTTTCGATTTTCAATTTTTTTTAATACTTTTATACTACATAAAAGTCTAATCAATTTTGGTGGTAGATTGAAAACTGTGTGTCCCTCCCTCTACCCCCTCACATTCCCAGATCATCAAACCCTAGAGAGATTCATACAAAATACACAGAGCGGTTGCGTATATATAACCGATTCGGACACGGATTATCATCGCCCAACCCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007276
ATGGACGATAGCTGCGCGGTTTGTGCGGAAAGCTTGGAGTGGGTGGCATACGGTGCTTGTGGCCACAAGGATGTTTGCTCCACCTGCGTCGCTCGCCTCCGATTTATTTGCAATGACCGCTGCTGCTGTATTTGCAAAACCGAGAACGACGTCGTTTTCGTCACCAAGGCTTTGGGAGACTATACAAAGACGATCAGCGACTTCACATTATTTCCCCCTGAAAGGAGAGAGGGTAAGATGGGTCAGTACTGGTACCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790406.1
MDDSCAVCAESLEWVAYGACGHKDVCSTCVARLRFICNDRCCCICKTENDVVFVTKALGDYTKTISDFTLFPPERREGKMGQYWYHDDTQAFFDDSDHYKMIKAMCRLSCSECDKEDLPDDGSRRRAKFRNIDQLKGHLFHKHKLIMCSLCLEGRKVFICEQKLYTRAQLSQHINTGDSEVDGTESERGGFSGHPPCGFCQTPFYGDNELYTHMETEHYTCHICRRQHPGEHEYYGNYDNLEIHFRQDHFLCEDDSCLAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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