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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000167`

染色体: Chr01 坐标: 2737290-2738054 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000167`
名称	SmilChr01G000167
描述	uncharacterized SmilChr01G000167
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2737290 - 2738054 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018897`
GeneID	`131018897`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018897`
原始查询	`SmilChr01G000167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=53.9; qcov=0.563; evalue=5.45e-34; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=55.4; qcov=0.945; evalue=3.46e-92; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018897

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803789.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803789.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803789.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803789.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2737379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C42,C46
`Chr1:2737379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C46
`Chr1:2737460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr1:2737495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C28,C62,C64
`Chr1:2737525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C87
`Chr1:2737533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C62
`Chr1:2737533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr1:2737566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:2737622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:2737632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B79,C56
`Chr1:2737634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C24
`Chr1:2737634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803789.1

254 aa

127

254

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 137-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803789.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	2.3e-18	66.3	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057803789.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	254	1.5e-48	165.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947806.1
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGGGCCTCCATCGCGATTATTTCGCCATCGAACCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCAGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018897
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGGCAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGGGCCTCCATCGCGATTATTTCGCCATCGAACCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCGTCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCAGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803789.1
MTVASSYRFDPPPPRPRKKRAVVRRDREGGAEGLHRDYFAIEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRPDAVGRLSFSPIQKCTVVVRQLAYGTSADCCDEYLRIGESTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRQPTTADVQRITAMHEACHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEAAVHFLANNSHHTRGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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