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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000172`

染色体: Chr01 坐标: 2833468-2836431 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000172`
名称	SmilChr01G000172
描述	uncharacterized SmilChr01G000172
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2833468 - 2836431 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020534`
GeneID	`131020534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020534`
原始查询	`SmilChr01G000172`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0946800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0946800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0946800` - identity=25.4; qcov=0.434; evalue=6.9e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805786.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805786.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805786.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805786.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805786.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2834368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B59,B87,B98
`Chr1:2834712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:2834765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B105,B122,B74,C18
`Chr1:2835040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B106
`Chr1:2835083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B83,C52,C54,C77
`Chr1:2835617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,C28,C32,C68,C74
`Chr1:2835715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C35
`Chr1:2835720`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A18,B14,B56,C12,C21,C56,C61
`Chr1:2835779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:2835789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:2835795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:2835912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805786.1

389 aa

194

389

DUF8566

PF29561 DUF8566 169-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805786.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	169	371	8e-54	183.2	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949803.1
TTTTCACTTTTATTCACGCGGTAAGTGAACTAGAATAGTCAAAAATCGGCTTCTGAAAATTACCGTCTGCAGTTCTGAAAATAGATCTAGGGTTTTTACTGTGGTGATCTATATTTGTGAGATTGACCTCGATTTGTTGAAGGATAGCCCACCCTGGTGAACAACTTGTGAAAGAAGGTGTTTTACCCAAAAAAAGGTACTAAGAATGGCTGCTCAATCCAAAAAGAAAAAGAATCAGAAAGGTTATGCTGAGGAAACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020534
ATGGCTGCTCAATCCAAAAAGAAAAAGAATCAGAAAGGTTATGCTGAGGAAACAGGTGATTCCCCTGTCAAAAAGAAGCAAAAGAGAATTTCACTTCCTGGTATAGTTATTCGAGAACCGATTTCTGGCCAAGTGAAGGGACCACGTACAATTCAACAAGATAAAAATAAGGGAAAAGGAAAAATAATTTTAGATCCCGACTCTGCCAAAGTAAAGAAATCGTGTACATTGCAACAATATAAAAACAAGAATCCAGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805786.1
MAAQSKKKKNQKGYAEETGDSPVKKKQKRISLPGIVIREPISGQVKGPRTIQQDKNKGKGKIILDPDSAKVKKSCTLQQYKNKNPDQMIEGECSKAAERKKNKGKRMLSEEDKNEESESSDDDDFEVVHPRVQIANLMDVRCKRRGVKENFPKKKKVRQIMASVPGLRTRTSPASLFKKISLMNEAKKQAVRDMGFGSVLQLGVRKLPGKLAFWVVEHFDCKSCSIVVGGNQGIRVDEDDVYRVYGFPKGKKEIEIFERK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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