当前解析结果
SmilChr01G000176| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000176 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000176 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000176 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 2896673 - 2900364 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007283 |
|---|---|
| GeneID | 131007283 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007283 |
| 原始查询 | SmilChr01G000176 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0004857 (enzyme inhibitor activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04043 (PMEI) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007283 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057790412.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.60000 | XP_057790412.1 |
| 3 | Cell wall | 细胞壁 | 0.20000 | XP_057790412.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790412.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790412.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:2897090 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C48 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057790412.1PF04043
PMEI 40-171 aa
XP_057790413.1PF04043
PMEI 40-171 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057790412.1 |
Pfam | PF04043 |
PMEI | Domain | 40 | 171 | 1.1e-11 | 45.8 | Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor |
XP_057790413.1 |
Pfam | PF04043 |
PMEI | Domain | 40 | 171 | 1.1e-11 | 45.8 | Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。