当前解析结果
SmilChr01G000179| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000179 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000179 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000179 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 2940477 - 2940953 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024469 |
|---|---|
| GeneID | 131024469 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024469 |
| 原始查询 | SmilChr01G000179 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024469 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810265.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057810265.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810265.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810265.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810265.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:2940477 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 29 | A13,A2,A7,B12,B137,B16,B19,B20,B23,B26,B29,B41,B55,B58,B6,B78,B86,C15,C17,C42,C46,C52,C74,C76,C79,C81,C9,D3,D5 |
Chr1:2940492 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr1:2940502 |
T |
TTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 13 | A20,A22,B1,B122,B123,B22,B33,B51,B59,B60,C14,C23,C37 |
Chr1:2940504 |
ACT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A20,A22,B1,B122,B123,B22,B33,B51,B59,B60,C14,C23,C81 |
Chr1:2940566 |
CTA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 91 | A1,A11,A19,A2,A24,A25,A4,A9,B1,B101,B102,B104,B105,B107,B11,B115,B118,B119,B12,B123,B124,B125,B130,B131,B137,B138,B139,B140,B16,B17,B19,B2,B22,B23,B24,B26,B3,B32,B35,B36,B37,B46,B47,B49,B53,B58,B6,B60,B65,B75,B76,B77,B78,B81,B83,B90,B93,B98,C10,C2,C21,C22,C24,C25,C26,C28,C29,C31,C35,C36,C42,C44,C46,C48,C51,C53,C60,C65,C68,C72,C73,C74,C79,C8,C80,C81,C83,C85,C87,D5,D8 |
Chr1:2940570 |
G |
GCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 80 | A1,A19,A25,A4,A9,B1,B101,B102,B104,B105,B107,B11,B115,B118,B119,B12,B123,B124,B125,B130,B131,B139,B140,B16,B17,B19,B2,B22,B24,B26,B3,B32,B35,B36,B37,B46,B47,B49,B53,B58,B6,B60,B65,B75,B76,B77,B78,B81,B83,B90,B93,C10,C2,C21,C22,C24,C25,C26,C28,C29,C31,C35,C42,C44,C46,C48,C51,C53,C60,C65,C68,C73,C74,C79,C8,C80,C81,C83,C85,D8 |
Chr1:2940578 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr1:2940605 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr1:2940611 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr1:2940618 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr1:2940621 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B124,B129,B54,C1 |
Chr1:2940633 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A10,A15,B53,B75,B97,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。