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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000187`

染色体: Chr01 坐标: 3183053-3185322 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000187`
名称	SmilChr01G000187
描述	uncharacterized SmilChr01G000187
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3183053 - 3185322 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007291`
GeneID	`131007291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007291`
原始查询	`SmilChr01G000187`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADH dehydrogenase ubiquinone complex I, assembly factor-like protein (DUF185) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822500]; symbol=AT3G28700; hit=AT3G28700; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NADH dehydrogenase ubiquinone complex I, assembly factor-like protein (DUF185) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822500]; symbol=AT3G28700; hit=AT3G28700; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G28700` (AT3G28700) NADH dehydrogenase ubiquinone complex I, assembly factor-like protein (DUF185) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822500] identity=73.6; qcov=1.01; evalue=1.01e-83; confidence=high
Rice	`Os01g0588800` - identity=66.5; qcov=1.02; evalue=1.22e-72; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0032981 (mitochondrial respiratory chain complex I assembly); GO:0035243 (protein-arginine omega-N symmetric methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02636 (Methyltransf_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790417.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790417.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790417.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790417.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790417.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3183329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B72
`Chr1:3183419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,C87,D4,D5
`Chr1:3183485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C46
`Chr1:3183613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:3183949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,D6
`Chr1:3184044`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	46	A1,A16,A19,A25,A3,A6,A8,B101,B103,B105,B11,B114,B128,B13,B136,B139,B25,B30,B36,B37,B40,B48,B53,B55,B6,B61,B8,B83,C16,C19,C23,C29,C3,C34,C48,C49,C50,C51,C52,C56,C63,C68,C69,C70,D2,D7
`Chr1:3184048`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B103,B139,B25,B30,C19,C49,C51,C56,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790417.1

161 aa

161

Methyltransf_28

PF02636 Methyltransf_28 52-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790417.1`	Pfam	`PF02636`	Methyltransf_28	Family	52	150	1e-22	81.5	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934434.1
TGAAAATATTATCAGCCCTAACACTTCTCTCTCTAGTTCGCCTCCCCCCAAATCCGAGTCCGCCGCGCCTTCCCCGAGTCCGCCGCGCCCCCCGATCTACCGCGCCTTCATCCAGCTCCCCCAGTCCATCGCGCCCTCGGTCTGCCTCCGTCTGCCCCAAAATCAGCGTATAATTCCCCACCTAACCAAACCCTAACACTCTCTTTCTCTCTTGTCCGCCACTCCACTACTCCAGTCTGTCGTGCCCTGGTCTTCTGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007291
ATGATGAGATTTTCTACCATTCCAGTTGCTGAGTACATGGAGGAAGTTTTAACGAATCCGAAAGCCGGATTTTACATGAATCGTGATGTTTTTGGATTTGGAGCCAAGGGGGACTTCATTACGTCCCCGGAAGTCAGCCAGATGTTTGGAGAGATGATTGGTGTTTGGGCAGTGTGCCTATGGGAGCAAATGGGACAGCCTGATAGGATCAACCTAGTCGAGCTTGGACCGGGCAGAGGAACTCTGATGGCCGATCTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790417.1
MMRFSTIPVAEYMEEVLTNPKAGFYMNRDVFGFGAKGDFITSPEVSQMFGEMIGVWAVCLWEQMGQPDRINLVELGPGRGTLMADLLRGVSKFKNFTASLQLHLVECSPALHQLQYQNLKCMDEDXSGTRCISTLAGNPVSWHAMLEQVPTGCKEFLFYDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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