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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000206`

染色体: Chr01 坐标: 3595259-3598970 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000206`
名称	SmilChr01G000206
描述	probable polygalacturonase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3595259 - 3598970 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007307`
GeneID	`131007307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007307`
原始查询	`SmilChr01G000206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase
产物	probable polygalacturonase
Arabidopsis	`AT3G16850` (AT3G16850) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820938] identity=59; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0658800` (OsPGL34) - identity=56.1; qcov=0.945; evalue=6.9e-177; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28); PF12708 (Pect-lyase_RHGA_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057790430.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057790430.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790430.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790430.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790430.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3596756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:3596834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:3597979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr1:3598095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B105,C21,C73
`Chr1:3598124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B106
`Chr1:3598349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B90,B92,B98,D6
`Chr1:3598415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:3598463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:3598484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790430.1

451 aa

226

451

Pect-lyase_RHGA_epim

Glyco_hydro_28

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 36-82 aa PF00295 Glyco_hydro_28 131-413 aa

XP_057790431.1

451 aa

226

451

Pect-lyase_RHGA_epim

Glyco_hydro_28

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 36-82 aa PF00295 Glyco_hydro_28 131-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790430.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	36	82	7.8e-08	33.1	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057790430.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	131	413	1.5e-34	120.3	Glycosyl hydrolases family 28
`XP_057790431.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	36	82	7.8e-08	33.1	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057790431.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	131	413	1.5e-34	120.3	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934447.1
ATTATTACGCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCACACCCCTCTTTCTCTCTCACACACACACATAAACACACTCAATGCAAGAAAGGAAACAATATAAACAAAAAAAAATTGCCGTTATTTTAGTGTCGGCAAATACCCGTTGCACAGAAAATTACGGGAGTGATTAATGCTTCCTAATTCTTGAAATTAAACCGATTTTACCCTACTCTCGCAAGCTTGCTTGTTTCCTATTATAATTGTCTTGAAAGATTTTTATTTTTTTT...

XM_057934448.1
TTGCACAGAAAATTACGGGAGTGATTAATGCTTCCTAATTCTTGAAATTAAACCGATTTTACCCTACTCTCGCAAGCTTGCTTGTTTCCTATTATAATTGTCTTGAAAGATTTTTATTTTTTTTTTTAATTTTAAATGCTTTCATTTTGCAACTCGATATATATGGTTTAAATATGAGATAGATAGACGAGGAGGTCTTTTTCTTATTCTGTGCTGTCCTTTTCATTTACCATTCATTTTCATTTTTTTTCTTGTTATAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007307
ATGAAGAGGCTAGTAATTCTTCTTTTGCTCGTGGCGTTGAGCAATGCTGCAGAGTACAATGGGGTATGCAAGTCCGATTGGCCATTGACCCCTCGGCCTCACAGTGTGTCCGTCTCAGAATTTGGGGCAGTGGGAGATGGGAAGACATTAAATACCGTAGCATTTCAGAATGCGATTTTCTATCTCAAGTCGTTTGCAGATAAGGGCGGTGCTCAGCTCTATGTTCCAGCAGGCAAGTGGCTCACCGGGTGCATCACTCT...

LOC131007307
ATGAAGAGGCTAGTAGTTCTTCTTTTGCTCGTGGCGTTGAGCAATGCTGCAGAGTACAATGGGGTATGCAAGTCCGATTGGCCATTGACCCCTCGGCCTCACAGTGTGTCCGTCTCAGAATTTGGGGCAGTGGGAGATGGGAAGACATTAAATACCGTAGCATTTCAGAATGCGATTTTCTATCTCAAGTCGTTTGCAGATAAGGGCGGTGCTCAGCTCTATGTTCCAGCAGGCAAGTGGCTCACCGGGTGCATCACTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790430.1
MKRLVVLLLLVALSNAAEYNGVCKSDWPLTPRPHSVSVSEFGAVGDGKTLNTVAFQNAIFYLKSFADKGGAQLYVPAGKWLTGCITLTSRLTLFLEKDAVILGSQDVLHWDVVDPLPSYGRGLEVPGRRYRSLINGQNLTDVVVTGNNGTIDGQGSIWWEQFRNHSLNYSRPHLVEFMWSNNIVVSNLTFLNAPAWNIHPAYCSKLLVQNITAYAPPDSPHTSGIVPDSSEYVCIENSNISTGYDAVVLKSGWDEYGLSY...

XP_057790431.1
MKRLVILLLLVALSNAAEYNGVCKSDWPLTPRPHSVSVSEFGAVGDGKTLNTVAFQNAIFYLKSFADKGGAQLYVPAGKWLTGCITLTSRLTLFLEKDAVILGSQDVLHWDVVDPLPSYGRGLEVPGRRYRSLINGQNLTDVVVTGNNGTIDGQGSIWWEQFRNHSLNYSRPHLVEFMWSNNIVVSNLTFLNAPAWNIHPAYCSKLLVQNITAYAPPDSPHTSGIVPDSSEYVCIENSNISTGYDAVVLKSGWDEYGLSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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