Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000217`

染色体: Chr01 坐标: 3792740-3793577 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000217`
名称	SmilChr01G000217
描述	uncharacterized SmilChr01G000217
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3792740 - 3793577 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007318`
GeneID	`131007318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007318`
原始查询	`SmilChr01G000217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0786500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0786500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0786500` - identity=39.1; qcov=0.343; evalue=8.28e-06; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057790436.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790436.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057790436.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057790436.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790436.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790436.1

134 aa

134

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 4-45 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790436.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	4	45	2.7e-07	31.3	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934453.1
TTAGATGTAAAATACATGATCGGAGTAATTAATTTGATTTTTCCCCCGGCGAACACTTACGACTAAATGTGCGCTGATGTGGCAATCGGAGTTCATACGTGGCAACGCCGGACCGTAGAACTAAACGCTGCCGTTTCAAATAAGAACAAGTCGACGTCGTTTTTCTACAAACGACGTCGTTTCCACTACTAATAGTTAATTTAAAGTATCTTCTCCCCCACTCGGCCTTCATTTTAGGGTTCTTCGATCTAGGGTTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007318
ATGTCTGAGCATCAGTGCAACCATAAGCTCCCTGCTGAAATCAGGACTTCTTGGACCGATGCCAACCCGGCCATGCGATTTTATCGTTGTCCCCTACAAGAAGCTGATTCTTGTTCTTATTTTGAGTTCATCGACCCGAGGCCTACTGAGTTGCAACGGAACTTCATTGCCAAGCTCAAACGCGAAAGAGATCAACTGCAAGACGAGCTTCGTAGGAAAACCTGTGAATGTCTTGATTTGAAGGAGGCCGAGGAAAATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790436.1
MSEHQCNHKLPAEIRTSWTDANPAMRFYRCPLQEADSCSYFEFIDPRPTELQRNFIAKLKRERDQLQDELRRKTCECLDLKEAEENAETYIVEHHEMGEEIVKLKEELTKLKRKCWLRGAVIGLLLGVLVVVHV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器