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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000221`

染色体: Chr01 坐标: 3866939-3868273 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000221`
名称	SmilChr01G000221
描述	uncharacterized SmilChr01G000221
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3866939 - 3868273 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999990`
GeneID	`130999990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999990`
原始查询	`SmilChr01G000221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=27.8; qcov=0.845; evalue=2.03e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2); PF13975 (gag-asp_proteas); PF30863 (PRO_PEG10-RTL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782057.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057782057.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782057.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782057.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3866989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:3867335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B36,C51,C6,C77
`Chr1:3867367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:3867437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:3867547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C12,C31
`Chr1:3867547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C31
`Chr1:3867732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A1,B3
`Chr1:3867732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B3
`Chr1:3867766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:3867787`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A4,B80
`Chr1:3867787`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A4,B80
`Chr1:3867793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B104,B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782057.1

328 aa

164

328

RVP_2

Asp_protease_2

gag-asp_proteas

PRO_PEG10-RTL1

PF08284 RVP_2 39-165 aa PF13650 Asp_protease_2 60-147 aa PF13975 gag-asp_proteas 60-149 aa PF30863 PRO_PEG10-RTL1 69-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782057.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	39	165	4.3e-25	88.8	Retroviral aspartyl protease
`XP_057782057.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	60	147	8.1e-09	36.8	Aspartyl protease
`XP_057782057.1`	Pfam	`PF13975`	gag-asp_proteas	Domain	60	149	3.7e-08	34.5	gag-polyprotein putative aspartyl protease
`XP_057782057.1`	Pfam	`PF30863`	PRO_PEG10-RTL1	Domain	69	165	8.2e-10	39.8	PEG10/RTL1 protease domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926074.1
ATGGAAGGAATTCTTCCTCTACCTCAACCACCACAACAACAACCTTTCCGCCGTCCAAATCGGCCTCATAAGCAGCTACCTACGCCGCAAGCAGGTAGACCACCACAATATCAAAGGATGTATGCTATCGACCAGAAGAATCAGGATAAGAATCAAGGAAACTTAACAGGTATTGGGGAACTGAAAGGTGTACCCATTGTTATTCTCTTTGATACAGGCACATCACATTCTTTCATCTCATATACATGTGTGGATACGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999990
ATGGAAGGAATTCTTCCTCTACCTCAACCACCACAACAACAACCTTTCCGCCGTCCAAATCGGCCTCATAAGCAGCTACCTACGCCGCAAGCAGGTAGACCACCACAATATCAAAGGATGTATGCTATCGACCAGAAGAATCAGGATAAGAATCAAGGAAACTTAACAGGTATTGGGGAACTGAAAGGTGTACCCATTGTTATTCTCTTTGATACAGGCACATCACATTCTTTCATCTCATATACATGTGTGGATACGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782057.1
MEGILPLPQPPQQQPFRRPNRPHKQLPTPQAGRPPQYQRMYAIDQKNQDKNQGNLTGIGELKGVPIVILFDTGTSHSFISYTCVDTLELNVEPAQLHLRVATPLGKVTTVTHVCPNLEFELGPLKLKAKTLRLMRMWSTYIILGMDWLAEHYAVIQCEQRQISFQPPGKEPTYFYNINRKWKKTPIIFALQANKILKEKGLPPNRQLEFTINLEPGAAPISKAPYRMVPAELQELKLQLQELLDMGFIRPSASPWEAPVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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