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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000223`

染色体: Chr01 坐标: 3953812-3955754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000223`
名称	SmilChr01G000223
描述	COBRA-like protein 7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3953812 - 3955754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000777`
GeneID	`131000777`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000777`
原始查询	`SmilChr01G000223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COBRA-like protein 7
产物	COBRA-like protein 7
Arabidopsis	`AT4G16120` (COBL7) COBRA-like protein-7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827298] identity=58.2; qcov=1.01; evalue=9.99e-142; confidence=high
Rice	`Os07g0690900` (P0597G07.128) - identity=47.6; qcov=1.04; evalue=2.43e-115; confidence=high
GO	GO:0010215 (cellulose microfibril organization); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04833 (COBRA_N); PF25079 (COB_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000777

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057783204.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057783204.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057783204.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783204.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3953896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B126,B20,B66,D4
`Chr1:3953971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B6,C67
`Chr1:3954041`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B72
`Chr1:3954041`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B72
`Chr1:3954133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:3954138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C39
`Chr1:3954138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:3954163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B24,C21
`Chr1:3954180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:3954238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:3954370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:3954440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783204.1

337 aa

168

337

COBRA_N

COB_C

PF04833 COBRA_N 86-265 aa PF25079 COB_C 274-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783204.1`	Pfam	`PF04833`	COBRA_N	Domain	86	265	1.7e-61	207.7	COBRA N-terminal domain
`XP_057783204.1`	Pfam	`PF25079`	COB_C	Domain	274	336	3e-21	77.1	COBRA family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927221.1
AGACCTATTCATATTTTCAGCTCATGCTTACTTCGCCTCACTAGCTAAAGACTCAATCAAAGATTCAAATCTAGCCGGCACGCCAACTCTATTAAATTATAATTTAGTACTATATATCATTTCAATTTTCACTCGATCAACCAATTTTACAAATTCCAACAAGAATTTTTCAAACGTCTTTCCCTATGTTTTATACGTAGTAATATTCGTTCCATCTCTCTGTTTAATATCTTCATGATCTTCTTTGATGATCGAAAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000777
ATGCGGGCGGTGGTGGAGTTGGTGGGGACGGAGTTCGGTGTGGCGCCGCCAAACGCCTCTTTGCCGGGAAATATTACTCTTGCTAATGACGCCTACCTGTGTCAAAATCTTACCACACAAGGTAACATCATGAACACTTGTTGCACGCTAGACTCGAACACGGAGACGAACATAACAAGGGGCCAAGAATTCTCCCCCCTCCAGACAGGCGACGTGACGATCATGTACGATGTATTGATGACATACGATCCCAACTATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783204.1
MRAVVELVGTEFGVAPPNASLPGNITLANDAYLCQNLTTQGNIMNTCCTLDSNTETNITRGQEFSPLQTGDVTIMYDVLMTYDPNYWAQLTISNHNPFGRLDNWEVSWEWMQGEFINSMRGALLQVVDSGDCIFGSQGQYYKNFDFSKVLSCARRPTIIDLPLSKANDSNLGLIPFCCRNGSILSPAMDPSKSKSSFQIEVYKMPPEINKTELSPPLNWRINSTVGPSYQCGQPVRVVPSLFPDPSGLPSQKAAIATWQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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