当前解析结果
SmilChr01G000224| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000224 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000224 |
| 描述 | formin-like protein 6 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 3980893 - 3981438 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001543 |
|---|---|
| GeneID | 131001543 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001543 |
| 原始查询 | SmilChr01G000224 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | formin-like protein 6 |
| 产物 | formin-like protein 6 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001543 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057784360.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057784360.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057784360.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057784360.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057784360.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:3980921 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr1:3980939 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B26,C45,C64 |
Chr1:3980951 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B117,B93,C47,C6 |
Chr1:3980966 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B10,B74,C47 |
Chr1:3980966 |
C |
CG |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B10,B74,C47 |
Chr1:3981199 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C58,C63,C72,D3 |
Chr1:3981210 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr1:3981219 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,B25 |
Chr1:3981245 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,B59,C49 |
Chr1:3981274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr1:3981284 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:3981301 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。