当前解析结果
SmilChr01G000229| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000229 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000229 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00300-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 4268096 - 4268583 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005289 |
|---|---|
| GeneID | 131005289 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005289 |
| 原始查询 | SmilChr01G000229 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=ATMG00300; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | hit=ATMG00300; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | ATMG00300- identity=41; qcov=0.84; evalue=1.32e-19; confidence=low |
| Rice | Os02g0671800- identity=37.3; qcov=0.6; evalue=3.76e-09; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13976 (gag_pre-integrs) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005289 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057788205.1 |
| 2 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.40000 | XP_057788205.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057788205.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057788205.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788205.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057788205.1PF13976
gag_pre-integrs 13-74 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057788205.1 |
Pfam | PF13976 |
gag_pre-integrs | Domain | 13 | 74 | 2.4e-16 | 60.0 | GAG-pre-integrase domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。