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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000233`

染色体: Chr01 坐标: 4393309-4394805 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000233`
名称	SmilChr01G000233
描述	uncharacterized SmilChr01G000233
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	4393309 - 4394805 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005691`
GeneID	`131005691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005691`
原始查询	`SmilChr01G000233`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=26.8; qcov=1.01; evalue=2.38e-44; confidence=low
Rice	`Os01g0967700` - identity=26.6; qcov=0.618; evalue=2.67e-11; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788740.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057788740.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057788740.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788740.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:4393318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:4393330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr1:4393357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	63	A13,A14,A16,A21,A22,A25,A7,B100,B108,B111,B112,B115,B117,B121,B126,B128,B133,B134,B136,B15,B16,B18,B31,B34,B35,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B58,B60,B63,B7,B73,B75,B79,B80,B93,B98,C11,C15,C16,C24,C32,C36,C43,C45,C47,C49,C59,C6,C68,C69,C71,C82,C85,D1,D10,D2,D4,D9
`Chr1:4393377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:4393390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:4393399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C77,D1
`Chr1:4393403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:4393414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:4393434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:4393437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:4393443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:4393446`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A16,A19,A6,B43,B58,B82,B97,C26,D3,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788740.1

498 aa

249

498

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 161-255 aa PF13456 RVT_3 354-473 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788740.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	161	255	5.7e-13	50.0	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057788740.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	354	473	6.3e-24	85.0	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932757.1
ATGGGCTTCCGGGATCTTGGCCTCTTCAACAAAGCAATGTTGGCAAAACAGACTTGGCGCATTCTTTGCAATGACTCGACTCTCTTGGCCCGCTGTTTAAAGGCTCGTTATTTTCCACGAACAGACATCCTCTTGGCTGGTAAGGCTCACAACCCATCTTTTACATGGAATAGCCTACTTGTGGGAAGAAGTCTGTTATTGGAAGGCATTTCTTGGAGAGTGGGAAACGGGAGTAGGATAAGGATCGGCAAAGATAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005691
ATGGGCTTCCGGGATCTTGGCCTCTTCAACAAAGCAATGTTGGCAAAACAGACTTGGCGCATTCTTTGCAATGACTCGACTCTCTTGGCCCGCTGTTTAAAGGCTCGTTATTTTCCACGAACAGACATCCTCTTGGCTGGTAAGGCTCACAACCCATCTTTTACATGGAATAGCCTACTTGTGGGAAGAAGTCTGTTATTGGAAGGCATTTCTTGGAGAGTGGGAAACGGGAGTAGGATAAGGATCGGCAAAGATAAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788740.1
MGFRDLGLFNKAMLAKQTWRILCNDSTLLARCLKARYFPRTDILLAGKAHNPSFTWNSLLVGRSLLLEGISWRVGNGSRIRIGKDKWIPEGNGVFSAARVPEAFENLTLDTFFLEDELSWDMERLATITQPTVLWKMATSIIPAADRMDTPIWPRDNFNSYTVKSGYLLACSSRQRNEASSSSLSSSPLWKWIWSLDVIPKVKHFMWRCVTEALHTTKALIHRSIDVDPLCRRCGLTTETPEYALRDCVWVSSLWEMSPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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