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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000246`

染色体: Chr01 坐标: 4586313-4590263 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000246`
名称	SmilChr01G000246
描述	dnaJ protein ERDJ3B-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	4586313 - 4590263 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015603`
GeneID	`131015603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015603`
原始查询	`SmilChr01G000246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dnaJ protein ERDJ3B-like
产物	dnaJ protein ERDJ3B-like
Arabidopsis	`AT3G62600` (ATERDJ3B) DNAJ heat shock family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825434] identity=79.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0156500` (OsDjB6) - identity=80; qcov=0.42; evalue=4.48e-83; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0051082 (GO:0051082)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF01556 (DnaJ_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057800029.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	1.00000	`XP_057800029.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057800029.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800029.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:4586629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B88
`Chr1:4586635`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B33,C15,C61,C62
`Chr1:4586635`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B33,C15,C61,C62
`Chr1:4586638`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B33,C15,C61,C62
`Chr1:4586638`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B33,C15,C61,C62
`Chr1:4586652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:4587089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B35,B83
`Chr1:4588711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:4588935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:4589504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C46
`Chr1:4590003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800029.1

345 aa

172

345

DnaJ

DnaJ_C

PF00226 DnaJ 26-88 aa PF01556 DnaJ_C 139-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800029.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	26	88	3.9e-29	101.3	DnaJ domain
`XP_057800029.1`	Pfam	`PF01556`	DnaJ_C	Domain	139	329	5.5e-36	124.6	DnaJ C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944046.1
GAAGCATGCTCTGATTGGCCAGCTGCCCCAAGACCACGTTGCATACTGAAACCTTCGTCGACTCGACCTCTCGGCACCTTTCCTCTGCAAATATGAAAAACTCGCACTCTTCCGCGGTTCAGCTTCTTCCTATCACTCGCACAGATAGAAATCTCTCGGCGGTGTTCGATTTCTCACGTATACGCACATTCGTTTGTAGTCGAGTACTGATTCCAGAAATTCGATAATTTCTGCAAGCTGTTCTTTTTGCTAGCGTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015603
ATGGCGCATCGAAGATCAAAGTTATTGCTGGTTTTATGCTTCGCGTCATACTGCCTGATCGCCATTGCAGCGAAGAGTTACTACGATGTTCTCCAAGTTCCGAAAGGCGCCTCGGATGAGCAAATAAAGCGTGCGTATCGGAAGCTCGCATTGAAGTATCATCCGGATAAAAATCAGGGGAACGAGGAGGCGAACAAGAGATTTGCGGAAATTAATAATGCTTATGAAGTTTTATCGGATAGCGAAAAGAGAGGTATATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800029.1
MAHRRSKLLLVLCFASYCLIAIAAKSYYDVLQVPKGASDEQIKRAYRKLALKYHPDKNQGNEEANKRFAEINNAYEVLSDSEKRGIYDRYGEEGLKQHAASGGRGGGGGMNIQDIFSSFFGGGPMEEEEKVVKGDDVIVDLDATLEDLYMGGTLKVWRVKNVIKPAPGKRRCNCRNEVYHKQIGPGMFQQMTEQVCEQCPNVKYEREGDFITVDIEKGMQDGQEVVFYEEGEPIIDGEAGDLKFRVRTAPHDRFRREGND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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