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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000269`

染色体: Chr01 坐标: 5209248-5209817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000269`
名称	SmilChr01G000269
描述	uncharacterized SmilChr01G000269
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5209248 - 5209817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007120`
GeneID	`131007120`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007120`
原始查询	`SmilChr01G000269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=37.3; qcov=0.794; evalue=1.38e-23; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007120

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790291.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790291.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790291.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057790291.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5209256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B133,B85,D10
`Chr1:5209259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B133,B85
`Chr1:5209270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C59
`Chr1:5209276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,B89
`Chr1:5209281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A15,B101,B28,B3,B36,B90,B95,C21,D10
`Chr1:5209285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B17,B2,C16,D7
`Chr1:5209287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr1:5209294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C65
`Chr1:5209296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B85
`Chr1:5209299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C9
`Chr1:5209300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B32,B66,C17,C21
`Chr1:5209302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790291.1

189 aa

189

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 35-187 aa PF03732 PEG10_N-capsid 44-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790291.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	35	187	5.5e-08	33.2	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057790291.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	44	123	7.9e-12	46.1	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934308.1
ATGGAAGACGCGCTAAGAGAACGTGGTAGAGGACGAGGACGTGGCCGTGGGCGCGGTAGAAGAGTTGTCCCCGAAGAACCTGTTCCACAAGTAGCACCGAATCGCACAGCCGAGGAAAAGTTTCGCAAGGAAAAACCTCCAATGTTTGATGGATTGGGCGAACCCGCGGATGCCGAGAAATGGGTTAGGACAATAGAACGGATCTTCAACTACATACGTTGTGACGATCAGGACAAAGTGGCATGCGCAACTTATCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007120
ATGGAAGACGCGCTAAGAGAACGTGGTAGAGGACGAGGACGTGGCCGTGGGCGCGGTAGAAGAGTTGTCCCCGAAGAACCTGTTCCACAAGTAGCACCGAATCGCACAGCCGAGGAAAAGTTTCGCAAGGAAAAACCTCCAATGTTTGATGGATTGGGCGAACCCGCGGATGCCGAGAAATGGGTTAGGACAATAGAACGGATCTTCAACTACATACGTTGTGACGATCAGGACAAAGTGGCATGCGCAACTTATCAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790291.1
MEDALRERGRGRGRGRGRGRRVVPEEPVPQVAPNRTAEEKFRKEKPPMFDGLGEPADAEKWVRTIERIFNYIRCDDQDKVACATYQLVDEADFWWELVRRTMTDEQWENFTWEEFKAELYEKYIPGCYRQKKQNEFWNLKQRAGTVTEYDKTFNQLSRYAPMLVDTDEKRAEKFRNGLHNEIAISLASQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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