当前解析结果
SmilChr01G000271| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000271 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000271 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000271 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 5363352 - 5364131 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007417 |
|---|---|
| GeneID | 131007417 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007417 |
| 原始查询 | SmilChr01G000271 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007417 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790449.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790449.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057790449.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057790449.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790449.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:5363363 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A22 |
Chr1:5363363 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr1:5363367 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B6,C67 |
Chr1:5363427 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B125,B140,B90,B92 |
Chr1:5363449 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 84 | A11,A14,A19,A21,A22,A23,A24,A3,A8,B1,B106,B109,B110,B117,B119,B120,B124,B125,B127,B129,B131,B137,B139,B14,B15,B16,B20,B21,B22,B3,B33,B40,B46,B47,B51,B56,B6,B60,B61,B63,B67,B68,B69,B72,B76,B86,B88,B89,B93,B96,B98,C12,C13,C14,C17,C22,C24,C26,C29,C3,C32,C41,C42,C44,C45,C47,C48,C55,C57,C60,C62,C64,C66,C68,C70,C73,C76,C82,C83,C85,D3,D4,D5,D7 |
Chr1:5363451 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,B27,C37 |
Chr1:5363468 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,B66,B89,C41 |
Chr1:5363473 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,B66 |
Chr1:5363482 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B19,B27,C37,D10 |
Chr1:5363486 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,C27,C79,C80 |
Chr1:5363517 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B79,C75 |
Chr1:5363559 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B123 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。