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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000276`

染色体: Chr01 坐标: 5466940-5467395 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000276`
名称	SmilChr01G000276
描述	zinc finger protein ZAT11-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5466940 - 5467395 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007803`
GeneID	`131007803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007803`
原始查询	`SmilChr01G000276`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein ZAT11-like
产物	zinc finger protein ZAT11-like
Arabidopsis	`AT5G56200` (AT5G56200) C2H2 type zinc finger transcription factor family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835719] identity=34.3; qcov=0.675; evalue=6.61e-11; confidence=low
Rice	`Os12g0583700` (RZF71) - identity=38.4; qcov=0.57; evalue=4.1e-11; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790729.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790729.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790729.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790729.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5466948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:5466969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:5466986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:5466996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B9,B95,C44
`Chr1:5466998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:5467048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:5467061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:5467266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A20,B48,C81,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790729.1

151 aa

151

zf-C2H2_6

PF13912 zf-C2H2_6 70-95 aa PF13912 zf-C2H2_6 102-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790729.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	70	95	1.5e-15	57.4	C2H2-type zinc finger
`XP_057790729.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	102	123	1.5e-15	57.4	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934746.1
ATGGAGCTCGAAATTCCCGAGGAGGAACAGGGATGTCAGTTCAGTCCGAAACTACCCGGATGGTCGAAAACGGGCAAGAGGACGAGGGCTCACCAGCGGTGCCCGTCCGACGACGAATTAGCGGCAGAGGATCTTCCACCAAAGAAGAGGAAGTTGGATTCAGGTAATAGTGAAAGAAATGGGAAAGATTTGTGTTGCATGAAGCAGCATAGATGCAGCATATGCAGGAGGTGTTTTAGTAGCTATCAAGCATTGGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007803
ATGGAGCTCGAAATTCCCGAGGAGGAACAGGGATGTCAGTTCAGTCCGAAACTACCCGGATGGTCGAAAACGGGCAAGAGGACGAGGGCTCACCAGCGGTGCCCGTCCGACGACGAATTAGCGGCAGAGGATCTTCCACCAAAGAAGAGGAAGTTGGATTCAGGTAATAGTGAAAGAAATGGGAAAGATTTGTGTTGCATGAAGCAGCATAGATGCAGCATATGCAGGAGGTGTTTTAGTAGCTATCAAGCATTGGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790729.1
MELEIPEEEQGCQFSPKLPGWSKTGKRTRAHQRCPSDDELAAEDLPPKKRKLDSGNSERNGKDLCCMKQHRCSICRRCFSSYQALGGHKAHHNKEGILEALHQCTFCYKVFSKGQALGGHRRHCQQPPIPKMFSFDLNELPPECSLEINKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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