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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000277`

染色体: Chr01 坐标: 5471634-5476489 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000277`
名称	SmilChr01G000277
描述	COP9 signalosome complex subunit 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5471634 - 5476489 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015838`
GeneID	`131015838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015838`
原始查询	`SmilChr01G000277`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COP9 signalosome complex subunit 2
产物	COP9 signalosome complex subunit 2
Arabidopsis	`AT2G26990` (FUS12) proteasome family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817241] identity=85.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0279200` - identity=92; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000338 (protein deneddylation); GO:0008180 (COP9 signalosome)
KEGG	-
Pfam	PF01399 (PCI); PF25983 (COPS2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015838

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800263.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057800263.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800263.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800263.1`
5	Midbody	Midbody	0.60000	`XP_057800263.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5475204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800263.1

439 aa

220

439

PCI

COPS2_C

PF01399 PCI 326-406 aa PF25983 COPS2_C 414-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800263.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	326	406	1e-23	84.1	PCI domain
`XP_057800263.1`	Pfam	`PF25983`	COPS2_C	Domain	414	438	2.4e-13	50.5	COP9 signalosome complex subunit 2, C-terminal helix

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944280.1
AAAGCCCAATTAGAGCTCCTAAAGTGTCTCAAAAGCCCATTTCTATCGAAGTGAAATTTCTCTCTATCTCTCTCCGCTCTCGCTCTCCCTCTCCCTCCTCTCATACTTGCTCTGGAGAATCCCCTAAATTTTTGTCGCTCTACACGAAATCTTGAGTTGAAAGGATATAATAAATCGCGATGGGTTCCGATGCTGATATGGAGGATTACGGGTTTGAGTACTCCGACGAGGAGCCGGAGGAACAGGATGTTGATATTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015838
ATGGGTTCCGATGCTGATATGGAGGATTACGGGTTTGAGTACTCCGACGAGGAGCCGGAGGAACAGGATGTTGATATTGAAAATCAGTATTACAACTCTAAAGGCTTAGTCGAAGCAGACCCCGAAGCAGCGCTTGAAGGTTTTGCAGAAGTGGTGCGTATGGAACCAGGAAAAGCTGATTGGGGATTTAAAGCTTTGAAGCAAACTGTTAAGCTTTACTATAAGCTTGGGAGGTACACGGAAATGATGGATGCTTACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800263.1
MGSDADMEDYGFEYSDEEPEEQDVDIENQYYNSKGLVEADPEAALEGFAEVVRMEPGKADWGFKALKQTVKLYYKLGRYTEMMDAYRDMLTYIKSAVTRNYSEKCINNIMDFISGSAGQNFSLLQEFYQTTLKALEEAKNERLWFKTNLKLCKIWFDIGEYGRMSKILKELHKSCQKEDGTDDQKKGTQLLEVYAIEIQMYTETKNNKKLKELYQKALSVKSAIPHPRIMGIIRECGGKMHMAERQWPDAATDFFEAFKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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