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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000290`

染色体: Chr01 坐标: 5678597-5681222 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000290`
名称	SmilChr01G000290
描述	chaperone protein ClpB3, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5678597 - 5681222 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016044`
GeneID	`131016044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016044`
原始查询	`SmilChr01G000290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein ClpB3, mitochondrial-like
产物	chaperone protein ClpB3%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G25140` (CLPB4) casein lytic proteinase B4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817052] identity=78.3; qcov=1; evalue=2.64e-71; confidence=high
Rice	`Os02g0181900` (ClpB-m) - identity=79.6; qcov=0.993; evalue=1.65e-71; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0034605 (cellular response to heat)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800574.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800574.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057800583.1`
4	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057800583.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057800592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5680421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:5680471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C86,C87
`Chr1:5680506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B35,B55,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944591.1
TTGGTTGAATTCTTCTATTGGCCTTCATTTTTTTTTCTTCCTGCCAGGTTTCAGGGGATACAATACAACCGGACCTATTGTGGGCTCTCACTTCACTTCTCTGTTGGAGAATGCTCGGAAATGTAAAAAACAAATGGGTGATTCGTTTTTGTCTGTTGAGCATCTAGTCTTGGCATTCCCTTCGGATAAAAGATTTGGGCAAAAGCTGCTCAACAATCTTCAACTAAGCGACAAGGCTTTGAAGGATGCTGTTGATGCCG...

XM_057944600.1
TTTCTTCCTGCCAGGTTTCAGGGGATACAATACAACCGGACCTATTGTGGGCTCTCACTTCACTTCTCTGTTGGAGAATGCTCGGAAATGTAAAAAACAAATGGGTGATTCGTTTTTGTCTGTTGAGCATCTAGTCTTGGCATTCCCTTCGGATAAAAGATTTGGGCAAAAGCTGCTCAACAATCTTCAACTAAGCGACAAGGCTTTGAAGGATGCTGTTGATGCCGTTCGTGGCAGTCAAAGAGTAACTGACCAAAATC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131016044
ATGGGTGATTCGTTTTTGTCTGTTGAGCATCTAGTCTTGGCATTCCCTTCGGATAAAAGATTTGGGCAAAAGCTGCTCAACAATCTTCAACTAAGCGACAAGGCTTTGAAGGATGCTGTTGATGCCGTTCGTGGCAGTCAAAGAGTAACTGACCAAAATCCAGAAGGTAAATATGAGGCACTCGAGAAATATGGAAATGACTTAACTGAGCTTGCCAGACGTGGAAAGCTTGACCCAGTTATTGGACGTGATGATGAGAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057800574.1
MGDSFLSVEHLVLAFPSDKRFGQKLLNNLQLSDKALKDAVDAVRGSQRVTDQNPEGKYEALEKYGNDLTELARRGKLDPVIGRDDEIRRCIQILSRRTKNNPVIIGEPGVGKTAIAEGLAQRIVRGDVPEPLLNRKVFKMKSANVGEFGLRIVFLCILWHVREAKPRLPQQRNGKPEKCPRGIEASEEAPEESKRARKRQRNRSE

XP_057800583.1
MGDSFLSVEHLVLAFPSDKRFGQKLLNNLQLSDKALKDAVDAVRGSQRVTDQNPEGKYEALEKYGNDLTELARRGKLDPVIGRDDEIRRCIQILSRRTKNNPVIIGEPGVGKTAIAEGLAQRIVRGDVPEPLLNRKLISPDMGSLLAGAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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