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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000295`

染色体: Chr01 坐标: 5823879-5825912 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000295`
名称	SmilChr01G000295
描述	uncharacterized SmilChr01G000295
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5823879 - 5825912 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008735`
GeneID	`131008735`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008735`
原始查询	`SmilChr01G000295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.3; qcov=0.725; evalue=5.38e-35; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.5; qcov=0.693; evalue=1.36e-39; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008735

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791781.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791781.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791781.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791781.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5823947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C26
`Chr1:5823951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:5823956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B56,B74,B96
`Chr1:5823987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:5824020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:5824039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:5824055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	74	A14,A16,A19,A5,B100,B108,B111,B112,B113,B115,B121,B122,B123,B126,B128,B13,B133,B136,B16,B17,B18,B2,B20,B24,B26,B29,B31,B33,B34,B40,B41,B42,B43,B48,B49,B5,B51,B52,B58,B60,B62,B7,B72,B73,B75,B79,B80,B85,B93,B97,B98,C11,C15,C19,C30,C36,C38,C43,C49,C6,C63,C67,C69,C71,C72,C76,C8,C83,D1,D2,D4,D6,D7,D9
`Chr1:5824094`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B138
`Chr1:5824094`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B138
`Chr1:5824111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C19
`Chr1:5824111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:5824123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791781.1

592 aa

296

592

MULE

PF10551 MULE 371-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791781.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	371	439	4.2e-08	34.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935798.1
ATGACGCATTCGTTGAGCTCGAGCTACCAATTGTATTATTTGACGACCAATCTATTTGGTAGGGAGACGAAATATGGCTTGACCACAGACGATGACGTGGAAGCCTTGTTGGCAACTGCCGACTATCCCATGGTGTACGTTGAGCACTACAACGGTCCAATTGAAGAAGCCTACATCCCTACTTTTGATTTTGCTCAGCCTTCGGTGCGGACAGATGAGGAACCTGAGCACGAAGTTGAAGCCTCGGTTGCAGCAGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008735
ATGACGCATTCGTTGAGCTCGAGCTACCAATTGTATTATTTGACGACCAATCTATTTGGTAGGGAGACGAAATATGGCTTGACCACAGACGATGACGTGGAAGCCTTGTTGGCAACTGCCGACTATCCCATGGTGTACGTTGAGCACTACAACGGTCCAATTGAAGAAGCCTACATCCCTACTTTTGATTTTGCTCAGCCTTCGGTGCGGACAGATGAGGAACCTGAGCACGAAGTTGAAGCCTCGGTTGCAGCAGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791781.1
MTHSLSSSYQLYYLTTNLFGRETKYGLTTDDDVEALLATADYPMVYVEHYNGPIEEAYIPTFDFAQPSVRTDEEPEHEVEASVAAGDDDYSEEDDEDFDPALQVGTASDASEDLLDDDLIDFTEIERAGWIRQSTTRDRNSTVETGDLTNWLVPLIPVDASASLVARESDHSRVDDLQKNSFYNSKDDLIIAVGLWNMKRGTETKVVRSDPGRVYFTCKHSDKCNFDLRASSHGGGMWRVHKLKEHSCEGDLRTAKKIKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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