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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000328`

染色体: Chr01 坐标: 6699434-6701465 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000328`
名称	SmilChr01G000328
描述	uncharacterized SmilChr01G000328
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	6699434 - 6701465 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010167`
GeneID	`131010167`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010167`
原始查询	`SmilChr01G000328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=49.7; qcov=0.731; evalue=1.42e-102; confidence=high
Rice	`Os09g0356100` - identity=60.8; qcov=0.23; evalue=1.1e-36; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010167

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793598.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793598.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793598.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793598.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793598.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:6699436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:6699456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B33,B49,C68
`Chr1:6699479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B3,C24,C46
`Chr1:6699493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C43,C71,D8
`Chr1:6699520`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	82	A14,A16,A18,A19,A21,A24,A25,A5,B100,B103,B108,B111,B112,B113,B115,B121,B122,B123,B126,B128,B13,B133,B136,B137,B139,B16,B18,B20,B21,B29,B31,B33,B34,B35,B40,B41,B42,B43,B49,B5,B51,B52,B56,B58,B60,B61,B62,B68,B7,B72,B73,B75,B79,B85,B93,B96,B98,C11,C15,C3,C30,C36,C38,C42,C43,C45,C48,C49,C6,C62,C63,C67,C69,C76,C8,C83,D1,D2,D4,D5,D6,D9
`Chr1:6699530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:6699554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B2,B33
`Chr1:6700272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B99
`Chr1:6700297`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B1,B61,C24,C58
`Chr1:6700297`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B1,B61,C24,C58
`Chr1:6700304`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A22,B14
`Chr1:6700304`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A22,B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793598.1

443 aa

222

443

DUF4371

PF14291 DUF4371 210-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793598.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	210	439	6.4e-89	298.3	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937615.1
ATGGCAACCAATGAGCACCGCAGAGATCTGAACAAGGTTTTCGAAGCAGCTGTGACGAACGTAGATATTCAACCAACTGATGACACATCGACCAAAGGAATTGATTTGACTGGGCTCACTCCACCGGGTTTTACTACGGAAATGAAGAGTGATGCATCTAAACCAAAAAAATCAAAAGGAATGGTAAAACAATCCAATCTCCAACATTTTATGTTCAAGAAAAGAAATAGTGAGAATCCTTCTAGTGCTAATGTCGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010167
ATGGCAACCAATGAGCACCGCAGAGATCTGAACAAGGTTTTCGAAGCAGCTGTGACGAACGTAGATATTCAACCAACTGATGACACATCGACCAAAGGAATTGATTTGACTGGGCTCACTCCACCGGGTTTTACTACGGAAATGAAGAGTGATGCATCTAAACCAAAAAAATCAAAAGGAATGGTAAAACAATCCAATCTCCAACATTTTATGTTCAAGAAAAGAAATAGTGAGAATCCTTCTAGTGCTAATGTCGCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793598.1
MATNEHRRDLNKVFEAAVTNVDIQPTDDTSTKGIDLTGLTPPGFTTEMKSDASKPKKSKGMVKQSNLQHFMFKKRNSENPSSANVAPTNDLPQEKAMDLGGLNANSVPLEEKELIYDVELLPHDPGKRISIMDYPPNMRDSIRRAYILKKPCRPKSHDFPQKDFGASSRRFIHSWFKKWDWLEYSIEKDAAFCFVCYLFKNEVENNVGGDAFVNGGFKSWNKPDRFAKHVGGVKSIHNLAYEKYVNLRDGKKKSILVSFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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