当前解析结果
SmilChr01G000331| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000331 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000331 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000331 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 6759336 - 6760391 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131010325 |
|---|---|
| GeneID | 131010325 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010325 |
| 原始查询 | SmilChr01G000331 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010325 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057793820.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057793820.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057793820.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793820.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793820.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:6759418 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B22,B54,B83,D8 |
Chr1:6759419 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,C48 |
Chr1:6759420 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C35,C77,D1 |
Chr1:6759429 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B57,D6 |
Chr1:6759449 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B99,C41,C62,C87 |
Chr1:6759466 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr1:6759472 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B75,C4,C5,C66 |
Chr1:6759495 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C64,C66,C71 |
Chr1:6759506 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 33 | A16,A19,A23,A6,B135,B140,B23,B26,B29,B34,B38,B44,B5,B63,B77,B8,B83,B95,C1,C19,C2,C23,C24,C25,C35,C37,C40,C50,C55,C68,C7,C79,D3 |
Chr1:6759507 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:6759509 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,C30 |
Chr1:6759516 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。