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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000336`

染色体: Chr01 坐标: 6865588-6870420 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000336`
名称	SmilChr01G000336
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	6865588 - 6870420 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010560`
GeneID	`131010560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010560`
原始查询	`SmilChr01G000336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=34.8; qcov=0.769; evalue=7.6e-61; confidence=low
Rice	`Os01g0852650` - identity=44.2; qcov=0.834; evalue=1.93e-96; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057794140.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057794140.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794140.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794140.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:6865658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B125,B96
`Chr1:6865665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B12,C86
`Chr1:6865763`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr1:6865763`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A19
`Chr1:6865876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B68,C13
`Chr1:6865879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C13
`Chr1:6865891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C1
`Chr1:6866025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B39,B7,B97
`Chr1:6866066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:6866089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B139
`Chr1:6866095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:6866106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B39,B7,B97,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794140.1

415 aa

208

415

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 56-142 aa PF10551 MULE 266-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794140.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	56	142	1.8e-21	77.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057794140.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	266	331	4.8e-18	66.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938157.1
ATGGATATTGGTAGTACATCTTCTCGCCGTTTGAATTTCGAGTATGCTCATGGGGATATGGTTGATGAGGGCAGTATGAATCAGTTGGTTAACTTGACAAGTATGAACAATAAGGAAGATACTCCGAAGATTGGTATGAGCTTTGATACTGAAGAGGATGCCTATGAATTTTATCTAAAGTATTCAAAACGTGTGGGCTTTGGTATTAGAAGAAGCAAAAGTCACAAGAACACATGTGGAGAATTAGTTGACAGGATCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010560
ATGGATATTGGTAGTACATCTTCTCGCCGTTTGAATTTCGAGTATGCTCATGGGGATATGGTTGATGAGGGCAGTATGAATCAGTTGGTTAACTTGACAAGTATGAACAATAAGGAAGATACTCCGAAGATTGGTATGAGCTTTGATACTGAAGAGGATGCCTATGAATTTTATCTAAAGTATTCAAAACGTGTGGGCTTTGGTATTAGAAGAAGCAAAAGTCACAAGAACACATGTGGAGAATTAGTTGACAGGATCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794140.1
MDIGSTSSRRLNFEYAHGDMVDEGSMNQLVNLTSMNNKEDTPKIGMSFDTEEDAYEFYLKYSKRVGFGIRRSKSHKNTCGELVDRIFCCSAQGKRSHDKRDVYVKKARPETRFDCQAKLKISSRETGKLCVVQFVEEHNHYLSSPNKIHLHRSHRKIAPAAALQIQMANDVGITPKASHDLMARQVGGRENLGFIPEDYKNYLRSKRTRDSRIGDTGGVLEYLQQMQFDDPNFFYAIQVDEDDLITNIFWADAKMRTDYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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