当前解析结果
SmilChr01G000339| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000339 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000339 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000339 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 6938873 - 6941858 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016436 |
|---|---|
| GeneID | 131016436 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016436 |
| 原始查询 | SmilChr01G000339 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016436 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801114.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057801114.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801114.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801114.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801114.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:6939056 |
CGA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A2 |
Chr1:6939073 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B12,B15 |
Chr1:6939080 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B46,C36 |
Chr1:6939097 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B126,B59,B98,C82 |
Chr1:6939099 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B80,D10,D9 |
Chr1:6939105 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr1:6939108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B7,B91,C76 |
Chr1:6939114 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C42,D9 |
Chr1:6939120 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B7,C76 |
Chr1:6939130 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 21 | B123,B130,B135,B15,B44,B48,B5,B58,B72,B78,B80,B90,B91,C1,C16,C20,C36,C47,C76,C84,D10 |
Chr1:6939138 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,C76 |
Chr1:6939147 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,A10,B125 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
10 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。