当前解析结果
SmilChr01G000346| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000346 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000346 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000346 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 7059764 - 7061098 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131010775 |
|---|---|
| GeneID | 131010775 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131010775 |
| 原始查询 | SmilChr01G000346 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131010775 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057794450.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057794450.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057794450.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057794450.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057794450.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:7059769 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,C16,C30 |
Chr1:7059771 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 10 | B139,B56,B57,B99,C16,C22,C34,C38,C4,C85 |
Chr1:7059811 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,C13,C82 |
Chr1:7059815 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B138,B77,D7 |
Chr1:7059827 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 50 | A14,A5,A6,A8,B105,B107,B114,B118,B12,B123,B124,B129,B131,B135,B15,B17,B21,B28,B29,B3,B32,B37,B38,B45,B62,B66,B67,B71,B81,B83,B86,B93,C1,C10,C19,C24,C26,C27,C40,C43,C47,C49,C55,C56,C62,C65,C66,C7,C75,C78 |
Chr1:7059830 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr1:7059833 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr1:7059837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B107,B2,B20,B98,C61 |
Chr1:7059864 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr1:7059926 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
Chr1:7059933 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B138,B55 |
Chr1:7059935 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 32 | A2,A4,B111,B112,B118,B124,B131,B137,B139,B15,B19,B23,B26,B36,B57,B65,B70,B74,B76,B77,B79,B96,C10,C14,C21,C22,C23,C34,C39,C45,D5,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。