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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000348`

染色体: Chr01 坐标: 7151706-7152569 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000348`
名称	SmilChr01G000348
描述	uncharacterized SmilChr01G000348
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	7151706 - 7152569 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011021`
GeneID	`131011021`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011021`
原始查询	`SmilChr01G000348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935]; symbol=AT4G00980; hit=AT4G00980; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935]; symbol=AT4G00980; hit=AT4G00980; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G00980` (AT4G00980) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935] identity=33.7; qcov=0.599; evalue=1.37e-27; confidence=low
Rice	`Os08g0421300` - identity=30.9; qcov=0.338; evalue=5.27e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011021

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057794773.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057794773.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057794773.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794773.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:7151714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B41
`Chr1:7151745`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A20,A3,C43
`Chr1:7151747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	122	A1,A10,A2,A20,A24,A3,A5,A8,B10,B102,B104,B105,B106,B108,B11,B111,B112,B113,B12,B120,B122,B126,B127,B128,B130,B132,B136,B137,B138,B139,B16,B18,B19,B22,B26,B27,B31,B33,B37,B38,B39,B4,B40,B44,B48,B50,B55,B59,B62,B65,B66,B69,B73,B74,B76,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B91,B92,B93,B96,B98,C10,C15,C16,C17,C21,C24,C25,C27,C3,C31,C32,C33,C37,C39,C4,C41,C42,C43,C45,C46,C48,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C74,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C86,C87,C9,D10,D8
`Chr1:7151752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B41,B78,C60,C84
`Chr1:7151753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B17
`Chr1:7151765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A24,B125,B35,B5,B58,B59,B7,B72,B84,B86,B95,C24,C48
`Chr1:7151767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A2,B100,B102,B105,B110,B119,B131,B17,B28,B37,B64,B72,B77,B85,B87,B95,C21,C31,C36,C41,C5,C60,C81,C82,D11
`Chr1:7151784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C53
`Chr1:7151788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B84,B95
`Chr1:7151795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B37,B4,B90,C22,C80
`Chr1:7151800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,C11,C69,D4
`Chr1:7151808`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B10,B132,C50,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794773.1

287 aa

144

287

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 44-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794773.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	44	218	1.6e-23	84.0	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938790.1
ATGGCGACAGGAAGCAACACCAACAACAACAACGTTCCAACTGTTCCGATCAACGTTCCAAATGCTCCAGCACCTGCCGAAAAGCTGGAAAAATTCTCAGGTTTTGAGTTTAAACGTTGGCAATCTAAGATGCTTTTTTATCTTACTACTTTGAATATGGCTCGTTTTCTGAATGAGTCTCCTCCAACTGTGGGGGAAGACGAAACTGATCCGCAAGTGCGTATCGCATATGATGCATGGCATCACAGCGACTTTCTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011021
ATGGCGACAGGAAGCAACACCAACAACAACAACGTTCCAACTGTTCCGATCAACGTTCCAAATGCTCCAGCACCTGCCGAAAAGCTGGAAAAATTCTCAGGTTTTGAGTTTAAACGTTGGCAATCTAAGATGCTTTTTTATCTTACTACTTTGAATATGGCTCGTTTTCTGAATGAGTCTCCTCCAACTGTGGGGGAAGACGAAACTGATCCGCAAGTGCGTATCGCATATGATGCATGGCATCACAGCGACTTTCTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794773.1
MATGSNTNNNNVPTVPINVPNAPAPAEKLEKFSGFEFKRWQSKMLFYLTTLNMARFLNESPPTVGEDETDPQVRIAYDAWHHSDFLCRNYILNGLDNTLYSVYSSTKTSKELWDSLETKYKSEDAGLKKFIVGRFLDYKMVDSKTNVEQVQEIQLIMHDILAEGMVLSESFQVAAMIEKLPPLWKDFKNYLKHKRKEMGLEDLIVRLRIEEDNRLSDNKMNKTSMEAKANLVESSNKKNASLKAKGQTRRIKRGSKAIAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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