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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000382`

染色体: Chr01 坐标: 7856244-7856957 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000382`
名称	SmilChr01G000382
描述	uncharacterized SmilChr01G000382
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	7856244 - 7856957 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012406`
GeneID	`131012406`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012406`
原始查询	`SmilChr01G000382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0630250` - identity=31.4; qcov=0.579; evalue=4.63e-08; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012406

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057796373.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057796373.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796373.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796373.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796373.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:7856252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,C26,C80,C83,C9
`Chr1:7856254`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	94	A11,A13,A15,A16,A2,A21,A24,A6,A7,B100,B102,B105,B107,B108,B112,B115,B12,B126,B130,B133,B134,B139,B140,B2,B22,B26,B28,B29,B30,B34,B38,B39,B4,B45,B46,B53,B57,B58,B68,B70,B71,B73,B76,B78,B79,B83,B87,B88,B94,B95,B99,C10,C12,C13,C15,C16,C20,C21,C23,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C36,C38,C39,C43,C45,C46,C48,C52,C54,C56,C59,C60,C62,C65,C7,C72,C77,C79,C81,C82,C84,C86,D1,D11,D3,D5,D8
`Chr1:7856258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B107,B44,B88
`Chr1:7856258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B44,B88
`Chr1:7856297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A21,B102,B108,B115,B125,B126,B134,B140,B22,B26,B38,B39,B4,B46,B53,B58,B76,B78,B83,B87,B95,C10,C16,C23,C24,C28,C29,C33,C36,C43,C46,C52,C54,C56,C59,C65,C77,C79,C81,D3
`Chr1:7856314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B37,B88
`Chr1:7856369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C8
`Chr1:7856390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B46,B93,C85,D3
`Chr1:7856398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C11,C69
`Chr1:7856443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B37,B88
`Chr1:7856454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B11,B125,B131,B138,B76,B78,B90,B92,C11,C27,C41,C6,C69,C8,D10
`Chr1:7856455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796373.1

214 aa

107

214

RVT_3

PF13456 RVT_3 65-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796373.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	65	182	2e-11	44.6	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940390.1
ATGTCTACTATTTGGAACATTTGGCATCATCGGAATAAAGTTGTGTTTGATGACGCTCATATTTCTGCGGTCTCCTTGACGGTGCAAATCAAGGCGTTTATTTTGGAAGCTTCTCGTTTCAGTCTTGGTGAGATGGCAAATTCGGTGGAGAAGCTGCTTGTTCTTCATGACCTTAGGCATAAGATCAATATTGATGGTTCGGTCCATGGTTTGCCTCTTTGTATTCATGCTGGGGATATCATTCGAGATTCCAACTTGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012406
ATGTCTACTATTTGGAACATTTGGCATCATCGGAATAAAGTTGTGTTTGATGACGCTCATATTTCTGCGGTCTCCTTGACGGTGCAAATCAAGGCGTTTATTTTGGAAGCTTCTCGTTTCAGTCTTGGTGAGATGGCAAATTCGGTGGAGAAGCTGCTTGTTCTTCATGACCTTAGGCATAAGATCAATATTGATGGTTCGGTCCATGGTTTGCCTCTTTGTATTCATGCTGGGGATATCATTCGAGATTCCAACTTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796373.1
MSTIWNIWHHRNKVVFDDAHISAVSLTVQIKAFILEASRFSLGEMANSVEKLLVLHDLRHKINIDGSVHGLPLCIHAGDIIRDSNLVIGRFHFSVGREWAFEAELFVLIIALEQVVSQGWDYIWIETDCTYPVDLFRTRSTTVPWRFFSTWRKIIQDIFGLHITISHIFREGNRVADFLASSVTDEGFWPFAIPDILQLVWDNKCFLPYVRIVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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