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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000397`

染色体: Chr01 坐标: 8154334-8155411 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000397`
名称	SmilChr01G000397
描述	uncharacterized SmilChr01G000397
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8154334 - 8155411 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013338`
GeneID	`131013338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013338`
原始查询	`SmilChr01G000397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF08284 (RVP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797420.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797420.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057797420.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057797420.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8154335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:8154346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B77
`Chr1:8154372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B68,B74,C60
`Chr1:8154374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B6,C13,C76,D1
`Chr1:8154391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr1:8154392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C49,C86,C87,D4
`Chr1:8154413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C49,C8,C86,C87,D4
`Chr1:8154432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B127,B30,C77,D6
`Chr1:8154447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr1:8154449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:8154476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B69,C24
`Chr1:8154477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797420.1

255 aa

128

255

zf-CCHC

RVP_2

PF00098 zf-CCHC 126-143 aa PF08284 RVP_2 173-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797420.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	126	143	9.2e-07	29.4	Zinc knuckle
`XP_057797420.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	173	231	6.2e-06	26.8	Retroviral aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941437.1
ATGGGATGCTATAGACAGAAGAAGCAGAACGAGTTCTGGAATCTGAAACAGAAAGCTGGGACAGTTACGGAGTACGATAAAGCCTTCAATCAGCTATCAAGATATGCTCCGATGCTGGTGGACATTGATGAGAAGCGCACAGAAAAATTCAGAAATGGATTACGCCATGAGATAGCGATTTCTTTAGATAGTGGTAAAGGAAAAAGAAAATGGAACGAGGGAACTGGTGGAAACCCTGGGAATGGACATGGAAAGAAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013338
ATGGGATGCTATAGACAGAAGAAGCAGAACGAGTTCTGGAATCTGAAACAGAAAGCTGGGACAGTTACGGAGTACGATAAAGCCTTCAATCAGCTATCAAGATATGCTCCGATGCTGGTGGACATTGATGAGAAGCGCACAGAAAAATTCAGAAATGGATTACGCCATGAGATAGCGATTTCTTTAGATAGTGGTAAAGGAAAAAGAAAATGGAACGAGGGAACTGGTGGAAACCCTGGGAATGGACATGGAAAGAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797420.1
MGCYRQKKQNEFWNLKQKAGTVTEYDKAFNQLSRYAPMLVDIDEKRTEKFRNGLRHEIAISLDSGKGKRKWNEGTGGNPGNGHGKKPWAANQNKNQHQNQQPQAIAPPPCPNCRKPHLGECMKGTNVCYYCGELGHFASACPKKRGGAPQQQNPGNQQRQNQGPGGYQGQPRNARAYALNQHQAAGDQENLASTINVFDVSIIALFDTGASHSFILPTASKKLELTLQSSETTSEVRITDGGRLNAKDVTSVLFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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