当前解析结果
SmilChr01G000408| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000408 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000408 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000408 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 8329720 - 8331318 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131013931 |
|---|---|
| GeneID | 131013931 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013931 |
| 原始查询 | SmilChr01G000408 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013931 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057797878.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057797878.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057797878.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057797878.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797878.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:8329724 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr1:8329726 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,C87 |
Chr1:8329727 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr1:8329731 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr1:8329739 |
ATT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 10 | B135,B22,B41,B60,B8,B83,B85,C10,C42,C52 |
Chr1:8329742 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 25 | A8,B108,B114,B135,B14,B22,B28,B31,B41,B60,B7,B8,B83,B85,B91,C10,C42,C51,C52,C56,C59,C60,C74,C77,D11 |
Chr1:8329745 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B108,B14,B28,B31,B7,C59,C77 |
Chr1:8329785 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr1:8329801 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B89,C10 |
Chr1:8329806 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr1:8329822 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr1:8329839 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C52,C62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。