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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000409`

染色体: Chr01 坐标: 8335223-8340175 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000409`
名称	SmilChr01G000409
描述	GPN-loop GTPase 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8335223 - 8340175 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006491`
GeneID	`131006491`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006491`
原始查询	`SmilChr01G000409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GPN-loop GTPase 3
产物	GPN-loop GTPase 3
Arabidopsis	`AT4G12790` (AT4G12790) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826891] identity=79.5; qcov=0.97; evalue=8.27e-160; confidence=high
Rice	`Os03g0714400` - identity=82.3; qcov=0.996; evalue=1.07e-171; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03029 (ATP_bind_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006491

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789625.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057789625.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789625.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057789625.1`
5	Midbody	Midbody	0.80000	`XP_057789625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8337532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C1
`Chr1:8337754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C1,C37
`Chr1:8337778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:8338914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789625.1

267 aa

134

267

ATP_bind_1

PF03029 ATP_bind_1 7-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789625.1`	Pfam	`PF03029`	ATP_bind_1	Domain	7	250	2.9e-86	289.9	Conserved hypothetical ATP binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933642.1
CATTTAATTTAACTCTCCTTAATACTCGTGCCTAGCGATGTCAATGGACGGGTTTTACCTGGACCAGAACCATTAAAATTGTTACGGTTCCGAAACCAGAACCGATCCATTGCTTATTAGATCCACACCGGACCGGACCATTAAGTGATAAATAAAATGGTTTTGGGTAGGTTAATTACCCATGAATCTTATCAGACCCATATACCCAATAATATCCATTACCAAACTTAAAAAAGCCCAAAAAAGATCAAAAAAGCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006491
ATGGGTTTCGCACAACTAGTCATTGGACCTGCTGGCAGTGGAAAGTCTACCTACTGTTCTAGCTTGTACCAACATTGTGAAACTATTGGCCGATCAATCAATATTGTAAACTTAGATCCTGCTGCTGAGAATTTCAACTATCCTGTAGCAATGGATATTAGGGAACTCATTTCTCTGGAGGATGTCATGGAGGAGCTTGGATTGGGGCCAAATGGTGGCCTTATCTACTGCATGGAGCACCTGGAAGAAAATCTGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789625.1
MGFAQLVIGPAGSGKSTYCSSLYQHCETIGRSINIVNLDPAAENFNYPVAMDIRELISLEDVMEELGLGPNGGLIYCMEHLEENLDEWLTEELDNYLDDDYLVFDCPGQIELFSHVPVLKNFVEHLKRKNFNVCVVYLLDSQFITDVTKFISGCMASLSAMVQLELPHVNILSKMDLVRNKRDIENYLNPEPQTLLAELNQRMAPQFGKLNKSLIELVDQYSMVSFFPLDLRKESSIQYILSQIDMSIQYGEDADVKIKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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