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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000414`

染色体: Chr01 坐标: 8382448-8384754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000414`
名称	SmilChr01G000414
描述	uncharacterized SmilChr01G000414
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8382448 - 8384754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006496`
GeneID	`131006496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006496`
原始查询	`SmilChr01G000414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OJ1123_G09.26-1; symbol=OJ1123_G09.26-1; hit=Os01g0390300; species=rice; confidence=low
产物	OJ1123_G09.26-1; symbol=OJ1123_G09.26-1; hit=Os01g0390300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0390300` (OJ1123_G09.26-1) - identity=27.7; qcov=0.744; evalue=8.71e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02721 (DUF223)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789627.1`
2	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057789627.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789627.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789627.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8383887`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	B28,B46,B56,B88,B96,C16,C62,C64,C66,C81,C86,D11,D3
`Chr1:8383888`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A16,B101,B103,B125,B127,B133,B17,B26,B41,B42,B43,B49,B64,B81,B90,B92,B97,C13,C24,C40,C52,C73,C74,D11
`Chr1:8383930`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B114,B129,B46,B61,B85,B98,C1,C34
`Chr1:8383932`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B123,B50,B54,C17,C50,C58
`Chr1:8383936`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	91	A11,A18,A19,A2,A22,A23,A25,A5,A6,A8,A9,B10,B100,B102,B105,B107,B113,B115,B119,B12,B120,B123,B124,B126,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B140,B16,B18,B2,B22,B27,B29,B32,B35,B38,B41,B47,B48,B50,B52,B54,B57,B63,B64,B66,B67,B69,B77,B82,B85,B86,B88,B91,B92,C12,C18,C19,C25,C26,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C41,C43,C45,C48,C49,C5,C51,C60,C63,C64,C66,C76,C8,C80,C81,C82,C87,D2,D5,D6,D7
`Chr1:8383959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C38
`Chr1:8383961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,D9
`Chr1:8383971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B55
`Chr1:8383989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:8383990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C34
`Chr1:8384032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B42,B84
`Chr1:8384143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	108	A11,A14,A19,A2,A20,A23,A25,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B103,B107,B11,B110,B113,B114,B119,B12,B121,B123,B126,B130,B131,B133,B134,B135,B140,B16,B17,B2,B22,B23,B27,B29,B32,B35,B41,B44,B47,B48,B52,B53,B57,B6,B60,B64,B66,B67,B69,B71,B75,B77,B8,B82,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B94,B99,C1,C10,C12,C15,C16,C17,C19,C20,C25,C3,C30,C32,C33,C35,C36,C38,C39,C41,C43,C48,C49,C50,C51,C56,C63,C64,C71,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C84,D2,D5,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789627.1

199 aa

100

199

DUF223

PF02721 DUF223 11-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789627.1`	Pfam	`PF02721`	DUF223	Domain	11	128	4.3e-15	56.6	Domain of unknown function DUF223

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933644.1
TCCACTCACACCATTACAATAAAACAGTTAGAATAAACAATATATATCATCGGATATAACAATATCAAAGCATCATTCGTCTAATACTTTTGTAAGTGCCCAAAAGTTTTCATCTTCATTGATGGCTCCTGTGTTTGGCTTGATCAAAGACCTGGAAGTAGGAAAGAGTAAATTTACATTGCAGTTGCGATTGGTTCGAAGCTACGAAGTTCCTCAATTTCACAATATCAACGAAATTGGCACACTTGAATGTGTTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006496
ATGGCTCCTGTGTTTGGCTTGATCAAAGACCTGGAAGTAGGAAAGAGTAAATTTACATTGCAGTTGCGATTGGTTCGAAGCTACGAAGTTCCTCAATTTCACAATATCAACGAAATTGGCACACTTGAATGTGTTTTTCATGATAAAGAGGGAAGTCGAATCCATGCAACCATTCAAAACTTGCAAATTGAGAATTTCAAGAATCTCCTCCACGAAGGGAATGTTTATGCAGTCATGAAATATATTGTAGGAAACAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789627.1
MAPVFGLIKDLEVGKSKFTLQLRLVRSYEVPQFHNINEIGTLECVFHDKEGSRIHATIQNLQIENFKNLLHEGNVYAVMKYIVGNNNMRTKTTTNRLKILIYKDTRIAELVDDGFPTHVLNLKSFEEIESMKTTPDFQDAPLFDVMGIIISCYKPVEKVINGKPTKLMDIMIEDLEYINYYYFLVALYFLSLLTSIFFI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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