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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000425`

染色体: Chr01 坐标: 8514196-8522310 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000425`
名称	SmilChr01G000425
描述	uncharacterized SmilChr01G000425
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8514196 - 8522310 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006504`
GeneID	`131006504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006504`
原始查询	`SmilChr01G000425`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H2A deubiquitinase (DUF3755) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819946]; symbol=AT3G07565; hit=AT3G07565; species=arabidopsis; confidence=high
产物	histone H2A deubiquitinase (DUF3755) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819946]; symbol=AT3G07565; hit=AT3G07565; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G07565` (AT3G07565) histone H2A deubiquitinase (DUF3755) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819946] identity=54.3; qcov=0.857; evalue=1.04e-57; confidence=high
Rice	`Os05g0305700` - identity=42.4; qcov=0.76; evalue=1.37e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12579 (DUF3755)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789636.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789636.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789636.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789636.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789636.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8514760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:8518127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:8518140`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B94
`Chr1:8518140`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B94
`Chr1:8519861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:8521752`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr1:8521752`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr1:8521891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789636.1

246 aa

123

246

DUF3755

PF12579 DUF3755 187-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789636.1`	Pfam	`PF12579`	DUF3755	Family	187	220	8.9e-17	61.2	Protein of unknown function (DUF3755)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933653.1
AAAGAATTTCGTGAAAGTATGGCAAAGTTTATTTTAGAAACAGAAAGTATGGCAAAGTTAAGGTCGCAATATTTTATTCATATTTGAGGAAGAAGACAGAAGAGGTAAAAATATCAGCTTAAACCCCTGTTCCGTACATCTTTTGTCTTCCTCAACTGAATACCGTTCTGATGTACTGATTGCCATACACCAATCCTCAATTCCTTTGTCTAACCCTAGAATTCAGCTTGAATCTGCCCAAATTGGCCACCGAATCTCTT...

XM_057933654.1
AAAGTTTATTTTAGAAACAGAAAGTATGGCAAAGTTAAGGTCGCAATATTTTATTCATATTTGAGGAAGAAGACAGAAGAGGTAAAAATATCAGCTTAAACCCCTGTTCCGTACATCTTTTGTCTTCCTCAACTGAATACCGTTCTGATGTACTGATTGCCATACACCAATCCTCAATTCCTTTGTCTAACCCTAGAATTCAGCTTGAATCTGCCCAAATTGGCCACCGAATCTCTTCCTCAGCTCATTAAATTCCCAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006504
ATGGCTGCGAGTGCTAACCCTTCAGGCGTTCATAGAAATGGTAACAATAATAATAATAACGGCAACAGCAACGGCAGCGTGCCGGAGAATACCAGCGGCAGCGGCGTGTCCTTGCCGGGGACAGCTCAAACCGCACTCCGCCATAACCCGGGCCTATCGCTTGATTGGACGCCTGAGGAACAATCGACGCTAGAAGATTTGCTTACCAAATATGCCTCTGAAACCAACATTATTCGGTATGCTAAAATTGCTCAGGCATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789636.1
MAASANPSGVHRNGNNNNNNGNSNGSVPENTSGSGVSLPGTAQTALRHNPGLSLDWTPEEQSTLEDLLTKYASETNIIRYAKIAQALKDKTVRDVALRCRWMNKKENGKRRKDDNNSRKSKDKKEKAIDSLPKSSQVANRSNGPPYVQPMLMESDDGISYKAIGGVTGQLLEQSANALDQISANFSAFKIHENIDLFCQARTNILSILNDFNDLPEIMKQMPPLPVKLNEDLANSILPRTSMVNNS

XP_057789637.1
MAASANPSGVHRNGNNNNNNGNSNGSVPENTSGSGVSLPGTAQTALRHNPGLSLDWTPEEQSTLEDLLTKYASETNIIRYAKIAQALKDKTVRDVALRCRWMNKKENGKRRKDDNNSRKSKDKKEKAIDSLPKSSQVANRSNGPPYVQPMLMESDDGISYKDFSQPSPAVSSPLEFECFKDNLIGSPTSWSRSTCLQGNLEVNSFYMFLRLLSANST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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