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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000430`

染色体: Chr01 坐标: 8591927-8592436 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000430`
名称	SmilChr01G000430
描述	uncharacterized SmilChr01G000430
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8591927 - 8592436 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014974`
GeneID	`131014974`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014974`
原始查询	`SmilChr01G000430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993]; symbol=AT5G28780; hit=AT5G28780; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993]; symbol=AT5G28780; hit=AT5G28780; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G28780` (AT5G28780) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=38.1; qcov=1.04; evalue=4.37e-34; confidence=medium
Rice	`Os07g0255200` - identity=35.6; qcov=0.947; evalue=1.51e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014974

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799167.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799167.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799167.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799167.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799167.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8591981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:8591996`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr1:8591996`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr1:8592050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B16
`Chr1:8592056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B16,C48
`Chr1:8592088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B136,B16,B86,C48
`Chr1:8592120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C37,C78
`Chr1:8592132`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A14,B139,B73,C37,C56,C78
`Chr1:8592212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:8592250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:8592271`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A21,B104,B108,B111,B17,B2,B24,B26,B30,B4,B47,B59,B74,B83,B93,B96,B98,C15,C16,C20,C26,C42,C45,C56,C63,C86,D10,D7
`Chr1:8592281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C28,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799167.1

169 aa

169

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 85-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799167.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	85	131	1.5e-20	73.3	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943184.1
ATGATACTACGGGATTCAAGTAATCCTATTGCATCCATAGTGAAAAGTACTTATCCAGACGTACTGCATATCCTGTCTAATCCAGAATATTTTAAGGATAGAGCTATCTTGGCCCCAACCAATGACATGGTTGATTCGATTAATGAATATGTCATGTCCTTGATGCCTGCCAAAGAAAGAGTATACCTTAGCTCGGATAACATTTGCAAAGATAATGGAGAAGTTGACCTCGATGATCAAGTCTTTTCAGTTGAGTATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014974
ATGATACTACGGGATTCAAGTAATCCTATTGCATCCATAGTGAAAAGTACTTATCCAGACGTACTGCATATCCTGTCTAATCCAGAATATTTTAAGGATAGAGCTATCTTGGCCCCAACCAATGACATGGTTGATTCGATTAATGAATATGTCATGTCCTTGATGCCTGCCAAAGAAAGAGTATACCTTAGCTCGGATAACATTTGCAAAGATAATGGAGAAGTTGACCTCGATGATCAAGTCTTTTCAGTTGAGTATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799167.1
MILRDSSNPIASIVKSTYPDVLHILSNPEYFKDRAILAPTNDMVDSINEYVMSLMPAKERVYLSSDNICKDNGEVDLDDQVFSVEYLNTIKCSGLPSHEIKLKEGCIIMLLRNIDLSNELCNGTRMIVTKLGARVIEAKLISSNNAGKKFSIARMIMSPSDFTKFPIRF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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