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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000431`

染色体: Chr01 坐标: 8602565-8606366 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000431`
名称	SmilChr01G000431
描述	glyoxylate/succinic semialdehyde reductase 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8602565 - 8606366 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006507`
GeneID	`131006507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006507`
原始查询	`SmilChr01G000431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glyoxylate/succinic semialdehyde reductase 1
产物	glyoxylate/succinic semialdehyde reductase 1
Arabidopsis	`AT3G25530` (GLYR1) glyoxylate reductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822139] identity=82; qcov=0.969; evalue=7.51e-173; confidence=high
Rice	`Os02g0562700` (OsGLYR1) - identity=80.6; qcov=0.99; evalue=2.66e-175; confidence=high
GO	GO:0003858 (3-hydroxybutyrate dehydrogenase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0050661 (NADP binding); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00650 (Butanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03446 (NAD_binding_2); PF14833 (NAD_binding_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789639.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789639.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789639.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789639.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8602781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:8603909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B37,B88
`Chr1:8603970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:8605090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B15,C39,D1
`Chr1:8605107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:8605133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:8605772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:8605835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,D11
`Chr1:8605886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B37,B88
`Chr1:8605901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C87
`Chr1:8605917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C1,C37
`Chr1:8606114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789639.1

292 aa

146

292

NAD_binding_2

NAD_binding_11

PF03446 NAD_binding_2 3-162 aa PF14833 NAD_binding_11 165-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789639.1`	Pfam	`PF03446`	NAD_binding_2	Domain	3	162	6.5e-46	157.0	NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase
`XP_057789639.1`	Pfam	`PF14833`	NAD_binding_11	Domain	165	282	4.3e-28	98.7	NAD-binding of NADP-dependent 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933656.1
ATTATAAATGATAAAAAATCATTCTCATATGCTTATCAATGGCGGACTGATTTTCAGTGCCAAATTAATTAATTTCACGAATCTTGGAAGCTTTTGTCGAGACTGTGCAGGCCGCTGAAAGACTATTGTATTTGCTTTGTTTGAGCCTTTCATTTTACCAATTTGTTGAGAAGAGACGACATAAAGAGAGAGATGGAGGAAATTGGGTTTTTGGGGCTCGGAATAATGGGCAAAGCCATGTCTATGAACTTGCTCAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006507
ATGGAGGAAATTGGGTTTTTGGGGCTCGGAATAATGGGCAAAGCCATGTCTATGAACTTGCTCAGCCATGGCTTTAAGGTTACTGTATGGAACCGCACTCTCTCGCGGTGTGACGAGTTGCTTGAGCATGGAGCAACTATCGGAGAAACTCCTGCAGCGGTAATTAAGAAATGCAAGTACACCATAGCAATGTTGTCTGATCCTGCTGCAGCTCTATCGGTGGTTTTTGATAAAGATGGCGTGCTGGAGCAAATTGGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789639.1
MEEIGFLGLGIMGKAMSMNLLSHGFKVTVWNRTLSRCDELLEHGATIGETPAAVIKKCKYTIAMLSDPAAALSVVFDKDGVLEQIGSGKNYIDMSTVDAETSSKISEAITSKGGCFLEAPVSGSKKPAEDGQLVILAAGEKALYDAALPVFDVLGKKSFYLGQVGNGAKMKLVVNMTMGSMMNAFSEGIVLADKSGLDPQTLLDVLDLGAIANPMFKMKGPSMIQGKYPPAFPLKHQQKDMRLALALGDEHSVAMPVAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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