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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000432`

染色体: Chr01 坐标: 8643226-8650236 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000432`
名称	SmilChr01G000432
描述	oligoribonuclease
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	8643226 - 8650236 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006508`
GeneID	`131006508`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006508`
原始查询	`SmilChr01G000432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oligoribonuclease
产物	oligoribonuclease
Arabidopsis	`AT2G26970` (AT2G26970) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817238] identity=60.5; qcov=0.988; evalue=8.27e-106; confidence=high
Rice	`Os02g0465500` - identity=57.8; qcov=1.02; evalue=5.59e-104; confidence=high
GO	GO:0000175 (3'-5'-RNA exonuclease activity); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00929 (RNase_T)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006508

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789640.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057789640.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789640.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789640.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057789640.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:8643709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C5
`Chr1:8649745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B53,B63,C20,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789640.1

251 aa

126

251

RNase_T

PF00929 RNase_T 73-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789640.1`	Pfam	`PF00929`	RNase_T	Domain	73	236	2.3e-34	120.0	Exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933657.1
TAGTATTTCGTACATTTCAGCGGCACTTTTCTTGCTCTCAGCGTCTTCCCCTTCACTGCGACTATCGATTCTTCACCACTTCGCCACCGCCTCCGCCATCGCCGACGTGACAAGACAAATTCAAACAGTAATCATCAAAAGTAAGATGGATAAGCTCTCGAATTCCTTTTCGTTGCTTGAGTTGGACGCTGATGATGCTAAGGAACACATTCCAACTGCCACCGCTGCGGCTGATAGTTGTGAAACGAGAGATAGCGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006508
ATGGATAAGCTCTCGAATTCCTTTTCGTTGCTTGAGTTGGACGCTGATGATGCTAAGGAACACATTCCAACTGCCACCGCTGCGGCTGATAGTTGTGAAACGAGAGATAGCGGTAAAGGAGTAGACAACGGCTTAGAAGATGGAACACTGTTGGAAAAGGAGAGTGTGGAGCAACAAACCTCAGAACGTATTGTGGGAGATTACAAGATGCCACTCGTGTGGATTGACCTGGAAATGACTGGTTTAAACATTGAAGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789640.1
MDKLSNSFSLLELDADDAKEHIPTATAAADSCETRDSGKGVDNGLEDGTLLEKESVEQQTSERIVGDYKMPLVWIDLEMTGLNIEVDRILEIACVITDGNLTKSVEGPDLVIHQPKECLDKMGEWCQEHHAESGLTEKVLQSTISEQEAEKQVIEFVKRHTGTAYTPLLAGNSVYMDLIFLRKYMPDLAAFFSHVLVDVSSVKALCLRWYPRDRRKAPQKENKHRAMDDIKESIAELKFYKEQIFKPKSRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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